MPI集群

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MPI集群

集群计算机是指用一组联网的PC或工作站来搭建成的，提供比单个PC（节点）计算性能高得多的计算机。

集群系统(Cluster)主要解决下面几个问题：
1．高可靠性（HA）。
2．高性能计算（HP）。
3．负载平衡。

HA：利用集群管理软件，当主服务器故障时，备份服务器能够自动接管主服务器的工作，并及时切换过去，以实现对用户的不间断服务。
HP：充分利用集群中的每一台计算机的资源，实现复杂运算的并行处理，通常用于科学计算领域，比如基因分析，物理与化学分析等。
负载平衡：即把负载压力根据某种算法合理分配到集群中的每一台计算机上，以减轻主服务器的压力，降低对主服务器的硬件和软件要求。

在实际应用中，最常见的情况是利用集群解决负载平衡问题，比如用于提供WWW服务。在这里主要展示如何使用LVS(Linux Virtial Server)来实现实用的WWW负载平衡集群系统

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1. MPI安装

1.1 APT安装

软件包中包含了mpich，可以直接通过apt-get下载安装。

sudo apt-get install -y mpich

观察mpicc版本信息：

mpicc -v

1.2 安装包安装

使用安装包安装教程

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2. 集群设置

1. 安装SSH，设置SSH免密登录
2. 设置NFS共享目录

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2.1 安装SSH，设置SSH免密登录

所谓的公钥，相当于自家系统的一个身份标识，是公开的。所谓的私钥，相当于一个认证文件，本质上书写了允许哪些机器对你进行免密访问。

部署MPI集群环境参考文章1
部署MPI集群环境参考文章2

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2.2 设置NFS共享目录

搭建NFS共享目录参考文章

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3. 基础编译坏境配置

在下载与安装编译环境之前，为了使软件包保持最新的状态，需要在命令行中键入命令sudo apt-get update，从源服务器下载最新的软件包列表

sudo apt-get update ：更新apt的资源版本目录

为了正常编译MPI代码，需要安装C, C++与Fortran的编译环境。

Ubuntu缺省情况下，并没有提供这些语言的编译环境，因此需要手动安装。
如果单独安装这些编译环境非常麻烦。幸运的是，build-essential工具提供了许多与编译相关的软件包，包括gcc/g++/gfortran等编译器、libc6-dev等必要的库与其他工具。于是，我们只需要通过包管理器安装build-essential即可。

apt-get命令的 -y 选项默认安装过程中同意所有的默认选择。

sudo apt-get install -y build-essential

下载与安装完成后，可键入下面的命令观察gcc版本信息。

gcc -v