tensorflow 读取机制及代码分析

参考:十图详解tensorflow数据读取机制(附代码) - 何之源的文章 - 知乎 https://zhuanlan.zhihu.com/p/27238630

在学习tensorflow的过程中,有很多小伙伴反映读取数据这一块很难理解。确实这一块官方的教程比较简略,网上也找不到什么合适的学习材料。今天这篇文章就以图片的形式,用最简单的语言,为大家详细解释一下tensorflow的数据读取机制,文章的最后还会给出实战代码以供参考。

一、tensorflow读取机制图解

首先需要思考的一个问题是,什么是数据读取?以图像数据为例,读取数据的过程可以用下图来表示:

 

假设我们的硬盘中有一个图片数据集0001.jpg,0002.jpg,0003.jpg……我们只需要把它们读取到内存中,然后提供给GPU或是CPU进行计算就可以了。这听起来很容易,但事实远没有那么简单。事实上,我们必须要把数据先读入后才能进行计算,假设读入用时0.1s,计算用时0.9s,那么就意味着每过1s,GPU都会有0.1s无事可做,这就大大降低了运算的效率。

 

如何解决这个问题?方法就是将读入数据和计算分别放在两个线程中,将数据读入内存的一个队列,如下图所示:

 

读取线程源源不断地将文件系统中的图片读入到一个内存的队列中,而负责计算的是另一个线程,计算需要数据时,直接从内存队列中取就可以了。这样就可以解决GPU因为IO而空闲的问题!

 

而在tensorflow中,为了方便管理,在内存队列前又添加了一层所谓的“文件名队列”

为什么要添加这一层文件名队列?我们首先得了解机器学习中的一个概念:epoch。对于一个数据集来讲,运行一个epoch就是将这个数据集中的图片全部计算一遍。如一个数据集中有三张图片A.jpg、B.jpg、C.jpg,那么跑一个epoch就是指对A、B、C三张图片都计算了一遍。两个epoch就是指先对A、B、C各计算一遍,然后再全部计算一遍,也就是说每张图片都计算了两遍。

tensorflow使用文件名队列+内存队列双队列的形式读入文件,可以很好地管理epoch。下面我们用图片的形式来说明这个机制的运行方式。如下图,还是以数据集A.jpg, B.jpg, C.jpg为例,假定我们要跑一个epoch,那么我们就在文件名队列中把A、B、C各放入一次,并在之后标注队列结束。

 

程序运行后,内存队列首先读入A(此时A从文件名队列中出队):

 

再依次读入B和C:

 

此时,如果再尝试读入,系统由于检测到了“结束”,就会自动抛出一个异常(OutOfRange)。外部捕捉到这个异常后就可以结束程序了。这就是tensorflow中读取数据的基本机制。如果我们要跑2个epoch而不是1个epoch,那只要在文件名队列中将A、B、C依次放入两次再标记结束就可以了。

 

二、tensorflow读取数据机制的对应函数

如何在tensorflow中创建上述的两个队列呢?

对于文件名队列,我们使用tf.train.string_input_producer函数。这个函数需要传入一个文件名list,系统会自动将它转为一个文件名队列。

此外tf.train.string_input_producer还有两个重要的参数,一个是num_epochs,它就是我们上文中提到的epoch数。另外一个就是shuffle,shuffle是指在一个epoch内文件的顺序是否被打乱。若设置shuffle=False,如下图,每个epoch内,数据还是按照A、B、C的顺序进入文件名队列,这个顺序不会改变:

如果设置shuffle=True,那么在一个epoch内,数据的前后顺序就会被打乱,如下图所示:

 

在tensorflow中,内存队列不需要我们自己建立,我们只需要使用reader对象从文件名队列中读取数据就可以了,具体实现可以参考下面的实战代码。

除了tf.train.string_input_producer外,我们还要额外介绍一个函数:tf.train.start_queue_runners。初学者会经常在代码中看到这个函数,但往往很难理解它的用处,在这里,有了上面的铺垫后,我们就可以解释这个函数的作用了。

在我们使用tf.train.string_input_producer创建文件名队列后,整个系统其实还是处于“停滞状态”的,也就是说,我们文件名并没有真正被加入到队列中(如下图所示)。此时如果我们开始计算,因为内存队列中什么也没有,计算单元就会一直等待,导致整个系统被阻塞。

而使用tf.train.start_queue_runners之后,才会启动填充队列的线程,这时系统就不再“停滞”。此后计算单元就可以拿到数据并进行计算,整个程序也就跑起来了,这就是函数tf.train.start_queue_runners的用处。

 

三、实战代码

我们用一个具体的例子感受tensorflow中的数据读取。如图,假设我们在当前文件夹中已经有A.jpg、B.jpg、C.jpg三张图片,我们希望读取这三张图片5个epoch并且把读取的结果重新存到read文件夹中。

对应的代码如下:

# 导入tensorflow
import tensorflow as tf 

# 新建一个Session
with tf.Session() as sess:
    # 我们要读三幅图片A.jpg, B.jpg, C.jpg
    filename = ['A.jpg', 'B.jpg', 'C.jpg']
    # string_input_producer会产生一个文件名队列
    filename_queue = tf.train.string_input_producer(filename, shuffle=False, num_epochs=5)
    # reader从文件名队列中读数据。对应的方法是reader.read
    reader = tf.WholeFileReader()
    key, value = reader.read(filename_queue)
    # tf.train.string_input_producer定义了一个epoch变量,要对它进行初始化
    tf.local_variables_initializer().run()
    # 使用start_queue_runners之后,才会开始填充队列
    threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess)
    i = 0
    while True:
        i += 1
        # 获取图片数据并保存
        image_data = sess.run(value)
        with open('read/test_%d.jpg' % i, 'wb') as f:
            f.write(image_data)

我们这里使用filename_queue = tf.train.string_input_producer(filename, shuffle=False, num_epochs=5)建立了一个会跑5个epoch的文件名队列。并使用reader读取,reader每次读取一张图片并保存。

运行代码后,我们得到就可以看到read文件夹中的图片,正好是按顺序的5个epoch:

 

如果我们设置filename_queue = tf.train.string_input_producer(filename, shuffle=False, num_epochs=5)中的shuffle=True,那么在每个epoch内图像就会被打乱,如图所示:

 

 

我们这里只是用三张图片举例,实际应用中一个数据集肯定不止3张图片,不过涉及到的原理都是共通的。

四、 带标签读取tf.train.slice_input_producer

tf.train.slice_input_producer是一个tensor生成器,作用是按照设定,每次从一个tensor列表中按顺序或者随机抽取出一个tensor放入文件名队列。

slice_input_producer(tensor_list, num_epochs=None, shuffle=True, seed=None,
                         capacity=32, shared_name=None, name=None)

第一个参数 tensor_list:包含一系列tensor的列表,表中tensor的第一维度的值必须相等,即个数必须相等,有多少个图像,就应该有多少个对应的标签。
第二个参数num_epochs: 可选参数,是一个整数值,代表迭代的次数,如果设置 num_epochs=None,生成器可以无限次遍历tensor列表,如果设置为 num_epochs=N,生成器只能遍历tensor列表N次。
第三个参数shuffle: bool类型,设置是否打乱样本的顺序。一般情况下,如果shuffle=True,生成的样本顺序就被打乱了,在批处理的时候不需要再次打乱样本,使用 tf.train.batch函数就可以了;如果shuffle=False,就需要在批处理时候使用 tf.train.shuffle_batch函数打乱样本。
第四个参数seed: 可选的整数,是生成随机数的种子,在第三个参数设置为shuffle=True的情况下才有用。
第五个参数capacity:设置tensor列表的容量。
第六个参数shared_name:可选参数,如果设置一个‘shared_name’,则在不同的上下文环境(Session)中可以通过这个名字共享生成的tensor。
第七个参数name:可选,设置操作的名称。

tf.train.slice_input_producer 与tf.train.string_input_producer一样,定义了样本放入文件名队列的方式,包括迭代次数,是否乱序等,要真正将文件放入文件名队列,还需要调用tf.train.start_queue_runners 函数来启动执行文件名队列填充的线程,之后计算单元才可以把数据读出来,否则文件名队列为空的,计算单元就会处于一直等待状态,导致系统阻塞。


代码实战

# -*- coding:utf-8 -*-
import tensorflow as tf
import numpy as np
 
# 样本个数
sample_num=5
# 设置迭代次数
epoch_num = 2
# 设置一个批次中包含样本个数
batch_size = 3
# 计算每一轮epoch中含有的batch个数
batch_total = int(sample_num/batch_size)+1
 
# 生成4个数据和标签
def generate_data(sample_num=sample_num):
    labels = np.asarray(range(0, sample_num))
    images = np.random.random([sample_num, 224, 224, 3])#或者仅输入文件名
    return images,labels
 
def get_batch_data(batch_size=batch_size):
    images, label = generate_data()
    # 数据类型转换为tf.float32
    images = tf.cast(images, tf.float32)
    label = tf.cast(label, tf.int32)
 
    #排队进入文件名队列
    input_queue = tf.train.slice_input_producer([images, label], shuffle=False)
    
    image_batch, label_batch = tf.train.batch(input_queue, batch_size=batch_size, num_threads=1, capacity=64)
    return image_batch, label_batch
 
image_batch, label_batch = get_batch_data(batch_size=batch_size)
 
with tf.Session() as sess:
    coord = tf.train.Coordinator()
    threads = tf.train.start_queue_runners(sess, coord)
        for i in range(epoch_num):  # 每一轮迭代
            print '************'
            for j in range(batch_total): #每一个batch
                print '--------'
                # 获取每一个batch中batch_size个样本和标签
                image_batch_v, label_batch_v = sess.run([image_batch, label_batch])
                # for k in
                print(image_batch_v.shape, label_batch_v)
    coord.request_stop()
    coord.join(threads)

 

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