做模拟准备工作

最新推荐文章于 2022-10-09 11:06:18 发布
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分类专栏： 生物信息
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本文链接：https://blog.csdn.net/qq_39212193/article/details/110130861
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中间缺少氨基酸的蛋白需要做模拟（图示化的模型链中断）

1、先用pymol打开需要模拟的蛋白质（可fetch）

2、进入RCSB PDB网站输入所需的蛋白质文件名，下载fasta序列，用note打开

3、将下载下来的序列与pymol显示的序列做对比，删除pymol前段灰色字体的序列（缺失的序列），保留后面的序列

4、进入trRosetta网站，将保留下来的序列粘贴到文本框提交等待结果

lengedd
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