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RSS订阅原创 MindSpore项目中_c_expression.py这样的文件名可能并不直接存在它是通过pybind11调用C++实现
from mindspore._c_expression import Tensor as Tensor_在MindSpore项目中，_c_expression.py这样的文件名可能并不直接存在 它是通过pybind11调用C++实现 请举个例子说明。
2024-05-09 17:44:40
577
原创 CI/CD与容器编排的结合
容器编排是一种管理和自动化容器化应用部署、扩展和维护的技术。它使得在多容器环境下，能够高效、可靠地部署和管理复杂的微服务架构应用。容器编排系统负责分配资源、调度容器、监控健康状况、处理故障恢复、实现服务发现、负载均衡和滚动更新等功能。
2024-05-08 15:15:03
794
原创 昇思训练平台的问题
昇思训练平台的问题data_pathtest_pathglove_path训练仓库1111123/ResNet50或者MindSpore/ResNet50_model/resnet50_224.ckptdata_pathdrizzlezyk/bee-img/train 修改为drizzlezyk/bee-img/train/ （！！！！！drizzlezyk/cifar10/ 假如这个 在第三个空格也要放上/##output 默认不填。
2023-05-20 22:32:12
576
原创 /libcublas.so.11: symbol cublasLtHSHMatmulAlgoInit version libcublasLt.so.11 not defined in file lib
debug
2022-11-10 23:51:41
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原创 修改Jupyter Notebook的界面显示
修改Jupyter Notebook的界面显示https://blog.csdn.net/weixin_42521211/article/details/114362807三、个人风格设置命令jt -t gruvboxd -T -N -lineh 120 -cellw 80%
2022-03-03 12:52:08
839
原创 存储过程procedure
##########################存储过程没有办法跟其他语句一起一句一句运行，要么全部运行，要么单独运行存储过程！！drop procedure if exists salesAdd0;CREATE TABLE t_sales12 (id int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,username varchar(32) COLLATE utf8_bin DEFAULT NULL COMMENT ‘用户名’,password varchar(64) COLL
2022-02-22 16:19:39
111
原创 mysql安装development
mysql安装development_如何正确安装MySQL Development版本？及配合PyMySQL工作所以按要求安装Visual Studio 2015、2017或者2019(我安装的是vs 2019，下载地址是：https://visualstudio.microsoft.com/zh-hans/downloads/)同时，要注意在安装Visual Studio，一定要在同时安装“数据存储和处理”组件，可以不勾选红色框，不然安装包会很大(同时，为了避免出现不必要的问题，我的安装路径是默认路
2022-02-19 15:22:14
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原创 创建永久库和临时库以及@@的作用
创建永久库和临时库以及@@的作用@@表示执行下一个操作，指针保持在当前记录。2、通过data步自主创建版本问题不好解决且训练集比较小的情况下，决定通过data步创建，代码格式：注：此处创建永久的数据集Libname ex ‘c:\SAS\dataset’ ; /* 创建永久数据库*/Data ex.GDP;Input year gdp1 gdp2 gdp3 @@; /* @@表示 连续输入*/cards;1978 28.18857 47.87643 23.9351979 31.26565
2022-02-10 16:55:41
666
原创 ppt_powerbi转ppt，数据分析ppt
ppt_powerbi转ppt，数据分析ppthttps://www.bilibili.com/video/BV1oW411f7TB?p=20&spm_id_from=pageDriverhttps://www.bilibili.com/video/BV1Vi4y1b76o?from=search&seid=1091876864834231068&spm_id_from=333.337.0.0https://www.bilibili.com/video/BV1Bm4y1U7Yh
2022-01-18 22:12:25
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原创 看文章捷径
看文章捷径就是用ppt 安装FIugre展现的顺序 把Figure 排序做好ppt然后用Figure作为关键词搜索文章，查看内容，来理清楚叙述的思路，科研思路note：假如英文困难的文章，可以用软件做整个文章翻译转docx并且排好版面，锻炼排版能力方式之一。然后多窗口图文对比着看，最后用知识图谱/思维导图的方式展现文章的逻辑思路！...
2022-01-12 10:53:45
166
原创 R绘图集合
R绘图集合R绘图(2): 离散/分类变量如何画热图/方块图 present TOP生物信息 2021-01-03 00:05R绘图(4): 散点图添加相关系数/回归方程密度图 R绘图(6): 拯救初学者——发表级绘图全能包ggpubr答读者问(5)：提取monocle2的拟时序/坐标重新画图...
2022-01-02 19:16:25
239
原创 ubuntu20.10报错问题
ubuntu20.10报错问题container error: cgroup subsystem devices not foundhttps://blog.csdn.net/Raink_LH/article/details/109595717https://cloud.tencent.com/developer/article/1853467https://blog.csdn.net/qq_38747027/article/details/120817248https://www.jianshu
2021-12-25 11:41:03
1302
原创 outSAMattributes NH HI AS nM CR CY UR UY
注意–outSAMattributes ALL指输出所有tag，如：NH:i:1 HI:i:1 AS:i:202 nM:i:3 NM:i:2 MD:Z:57T14C32 jM:B:c,-1 jI:B:i,-1 MC:Z:45S105M默认情况下（指不加该参数）只有： NH:i:1 HI:i:1 AS:i:292 nM:i:3 这几个(好像是，待验证)，也可以指定只输出哪几个。因为有些下游分析软件会要求bam中药有NM才能统计。作者：巴拉巴拉11链接：https://www.jianshu.com/p/
2021-12-13 21:09:49
400
原创 outSAMattributes
注意–outSAMattributes ALL指输出所有tag，如：NH:i:1 HI:i:1 AS:i:202 nM:i:3 NM:i:2 MD:Z:57T14C32 jM:B:c,-1 jI:B:i,-1 MC:Z:45S105M默认情况下（指不加该参数）只有： NH:i:1 HI:i:1 AS:i:292 nM:i:3 这几个(好像是，待验证)，也可以指定只输出哪几个。因为有些下游分析软件会要求bam中药有NM才能统计。作者：巴拉巴拉11链接：https://www.jianshu.com/p/
2021-12-09 23:06:13
480
原创 Ubuntu系统安装ghostscript seq2logo
Ubuntu系统安装ghostscript seq2logo(py2) zhul@DESKTOP-574GPKI:/mnt/e/yyp/data/newclean$ conda install ghostscriptghostscript（以下简称gs）是Ubuntu系统下查看GMT生成的ps、eps格式图片文件的软件，利用源码安装的方式介绍如下：首先，要在Github上下载gs最新的源码，网站为： https://github.com/ArtifexSoftware/ghostpdl-downloa
2021-12-07 19:10:42
1100
原创 had non-zero exit status安装R包
https://blog.csdn.net/weixin_44343226/article/details/113776261?spm=1001.2101.3001.6650.1&utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7ECTRLIST%7Edefault-1.no_search_link&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7
2021-11-25 15:23:54
757
原创 PCA方差为0的列
我认为您没有在正确地寻找零方差列。让我们尝试一些伪数据。首先，可接受的矩阵：10x100：PCA不能将常数的列/全部为零的列的方差重新调整为一mat <- matrix(rnorm(1000, 0), nrow = 10)还有一个带有零方差列的列。我们称之为oopsmat。const <- rep(0.1,100)oopsmat <- cbind(const, mat)oopsmat的前几个元素如下所示： const
2021-11-02 14:38:33
3848
原创 picard报错的问题
picard报错的问题parallel --will-cite --jobs 2 --delay 0.5 'picard MarkDuplicatesINPUT={}OUTPUT={.}.rmdupMETRICS_FILE={.}.dups.logREMOVE_DUPLICATES=trueBARCODE_TAG=RGTMP_DIR=/mnt/f/temp/ ’ ::: SubBarcodes.Name.Name.Name.Species.*.bam#####失败报错 Name的问题Nam
2021-10-31 20:02:31
2305
2
原创 wsl转wsl2与局域网内网访问填坑
wsl转wsl2与局域网内网访问填坑 https://www.cnblogs.com/allen167/p/14775844.html
2021-10-27 17:09:23
766
原创 R语言循环里正常保存python 中 sparse matrix的应用和基本操作GO term heatmap and dot pic
R语言里一些画图程序不能在循环里正常保存的解决办法 (2020-07-06 11:42:47)转载▼标签： 生物信息 科学 分类： 学术-R这个目前只知其然不知其所以然，但是解决问题是可以的。Seurat里的DimPlot画图，单独使用的时候没有问题，用pdf+dev.off()可以正常输出保存图片，但是放在循环里却无法实现，原因不明。但是解决办法也很简单，加一个print函数就可以了。示例代码如下：pdf(“abc.pdf”)p1<-DimPlot(mouse.data)print(p
2021-09-30 09:24:19
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原创 数据分析技术工具
数据分析Tableauhttps://www.bilibili.com/video/BV1tK4y1x74W?from=search&seid=18343094153577913819https://www.bilibili.com/video/BV1qQ4y1N7LD?from=search&seid=7850891874425723586https://www.bilibili.com/video/BV1CK411574t/?spm_id_from=333.788.recomme
2021-07-23 11:31:03
1325
原创 ps修改图片
ps修改图片###ctr +E ctr+Jhttps://www.bilibili.com/video/BV1hr4y1w7xo/?spm_id_from=autoNexthttps://www.bilibili.com/video/BV1No4y117XW?-Arouter=story&p=1&share_medium=android&share_plat=android&share_source=WEIXIN&share_tag=s_i×
2021-07-19 15:35:35
649
原创 gatk4的一些介绍
gatk4的一些介绍#GENOMEwget -t 0 -c https://storage.cloud.google.com/genomics-public-data/resources/broad/hg38/v0/Homo_sapiens_assembly38.fasta &wget -t 0 -c https://storage.cloud.google.com/genomics-public-data/resources/broad/hg38/v0/Homo_sapiens_assemb
2021-07-06 10:39:19
397
原创 学习资源Gwas
CaseIS0a017f15-1c6b-45e7-8d55-e0a71df1b2e8ANDData CategoryISTranscriptome Profilinghttps://portal.gdc.cancer.gov/auth/api/data?annotations=true&related_files=trueGWAS数据分析专题https://mp.weixin.qq.com/s?src=11×tamp=1623895271&ver=3135
2021-06-17 11:58:13
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原创 shell脚本中单行或多行注释(屏蔽)方法
shell脚本中单行或多行注释(屏蔽)方法方法二:<<eof被注释的多行内容eofhttps://blog.csdn.net/u014472548/article/details/88977287?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522162304475016780271510613%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334…%2522%257D&
2021-06-07 13:52:15
492
原创 用wsl版本1的同步固定ip远程登录
用wsl版本1的同步固定ip远程登录wsl2是windows内置的linux子系统，安装步骤如下：1.Win10 版本号为 2004（内部版本19041或更高）即可，如果低于此版本可使用 Windows 10 易升工具手动升级。下载 Windows 10 易升工具：https://www.microsoft.com/zh-cn/software-download/windows10如果之前没有用过 WSL，那么首先需要为Linux启用Windows子系统:dism.exe /online /e
2021-06-04 16:18:19
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原创 wls2 与宿主机的ip不在同一网段的问题
wls2 与宿主机的ip不在同一网段的问题总结：1、当wsl2的ip为172开头的网段，宿主机为192开头的时候。主机可以访问wsl2，wls2由于防火墙不能访问宿主机的ip2、当上面的ip不是同一网段在局域网时候，wls2（172）不能之间连同另外一台主机的wls2(172开头)。但是另外一台主机的wls2ip也是192开头，则可以单向连同。所以综上所述，只有wls2的ip跟主机的ip都在同一网段，才能互相连通。sudo ifconfig eth0 172.20.121.18 netmask 255
2021-06-03 20:19:47
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原创 含spike-in的单细胞分析
含spike-in的单细胞分析#需要格外注意的一点是：如果实验设计中加入的spike-in #transcripts(比如ERCC)，在比对时一定要将这些参考序列加入到我们的参考基因组中，再进行比对。否则可以理解加了也是白加。#数据包，提供很多示例scRNA-seq表达矩阵信息https://www.jianshu.com/p/a70c831c95f5$ head fastqid.txtftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR679/001/SRR6790711/SRR67
2021-06-03 14:10:35
2427
原创 spik-in
https://github.com/descostesn/BiocNYC-ChIPSeqSpikehttps://rdrr.io/bioc/ChIPSeqSpike/f/inst/doc/ChIPSeqSpike.pdfhttps://rdrr.io/bioc/ChIPSeqSpike/f/vignettes/ChIPSeqSpike.Rmdhttps://mp.weixin.qq.com/s/La_AwYYf0atmFvsHh7AL6QI-2 The dataIn this workshop
2021-06-03 10:58:36
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