python
qq_39306047
这个作者很懒,什么都没留下…
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mindsponge 使用
mindsponge原创 2023-03-08 18:21:07 · 219 阅读 · 0 评论 -
docker的conda环境中安装mindspore(CPU版本?)
华为mindspore安装原创 2022-11-11 13:19:02 · 785 阅读 · 0 评论 -
/libcublas.so.11: symbol cublasLtHSHMatmulAlgoInit version libcublasLt.so.11 not defined in file lib
debug原创 2022-11-10 23:51:41 · 6663 阅读 · 6 评论 -
修改Jupyter Notebook的界面显示
修改Jupyter Notebook的界面显示https://blog.csdn.net/weixin_42521211/article/details/114362807三、个人风格设置命令jt -t gruvboxd -T -N -lineh 120 -cellw 80%原创 2022-03-03 12:52:08 · 877 阅读 · 0 评论 -
Ubuntu系统安装ghostscript seq2logo
Ubuntu系统安装ghostscript seq2logo(py2) zhul@DESKTOP-574GPKI:/mnt/e/yyp/data/newclean$ conda install ghostscriptghostscript(以下简称gs)是Ubuntu系统下查看GMT生成的ps、eps格式图片文件的软件,利用源码安装的方式介绍如下:首先,要在Github上下载gs最新的源码,网站为: https://github.com/ArtifexSoftware/ghostpdl-downloa原创 2021-12-07 19:10:42 · 1109 阅读 · 0 评论 -
R语言循环里正常保存python 中 sparse matrix的应用和基本操作GO term heatmap and dot pic
R语言里一些画图程序不能在循环里正常保存的解决办法 (2020-07-06 11:42:47)转载▼标签: 生物信息 科学 分类: 学术-R这个目前只知其然不知其所以然,但是解决问题是可以的。Seurat里的DimPlot画图,单独使用的时候没有问题,用pdf+dev.off()可以正常输出保存图片,但是放在循环里却无法实现,原因不明。但是解决办法也很简单,加一个print函数就可以了。示例代码如下:pdf(“abc.pdf”)p1<-DimPlot(mouse.data)print(p原创 2021-09-30 09:24:19 · 171 阅读 · 0 评论 -
安装coopup
conda env list109 pip install https://github.com/open2c/coolpuppy/archive/master.zip110 pip install Cython111 pip install https://github.com/open2c/coolpuppy/archive/master.zip112 pip install numpy113 pip install https://github.com/open2c/coolpup原创 2021-05-18 00:39:40 · 206 阅读 · 0 评论 -
数学建模
https://blog.csdn.net/qq_46126118/article/details/113242557?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522161836383416780264094736%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&request_id=161836383416780264094736&am原创 2021-04-14 09:51:52 · 92 阅读 · 0 评论 -
ssh已经解决登陆局域网内其他电脑的jupyter ,jupyter 未解决wsl2 直接ping不通我的remote server
jupyter 未解决https://blog.csdn.net/swordsm/article/details/107948497?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522161784837516780264088906%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334…%2522%257D&request_id=161784837516780264088906&b原创 2021-04-08 10:34:20 · 701 阅读 · 0 评论 -
computeMatrix: Optional arguments
computeMatrix: Optional argumentsonly for scale-regions mode:| Command | Expected Input | Explanation | |:----????:----????:----| | --regionBodyLength | INTEGER | Distance in bp to which all regions are going to be fitted. (default: 1000) | | --startLabe原创 2020-12-08 15:52:06 · 953 阅读 · 0 评论 -
pandas之多行按类合并为一行
pandas之多行按类合并为一行https://blog.csdn.net/qq_38412868/article/details/105332811python-pandas 实现多行转换成一行https://blog.csdn.net/baidu_38409988/article/details/102828570?utm_medium=distribute.wap_relevant.none-task-blog-title-5...原创 2020-10-24 21:45:47 · 1349 阅读 · 0 评论 -
判断dataframe、list是否为空
判断dataframe、list是否为空https://blog.csdn.net/butterfly1107/article/details/80095654原创 2020-10-24 21:44:43 · 265 阅读 · 0 评论 -
【二维数组的排序==按照某列排序】Python sorted() 函数 配合lambda用法
Python sorted() 函数 配合lambda用法https://blog.csdn.net/weixin_42280517/article/details/80500632?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-8.add_param_isCf&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-Blog原创 2020-10-23 09:41:31 · 781 阅读 · 0 评论 -
怎样用pythonpandas对数值型字段进行分组?--and插入列
怎样用pythonpandas对数值型字段进行分组?—插入列https://blog.csdn.net/qq_35990702/article/details/82313055?biz_id=102&utm_term=pandas%20%E6%A0%B9%E6%8D%AE%E6%9F%90%E5%88%97%E5%A2%9E%E5%8A%A0%E5%88%86%E7%BB%84%E6%A0%87%E8%AE%B0&utm_medium=distribute.pc_search_result原创 2020-10-11 12:44:06 · 255 阅读 · 0 评论 -
series转换成dataframe
series转换成dataframehttps://blog.csdn.net/weixin_41100555/article/details/88555658?biz_id=102&utm_term=Series%20%E7%BB%84%E6%88%90df&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2allsobaiduweb~default-2-88555658&spm=1018.2118.3001.4187原创 2020-10-11 11:17:54 · 227 阅读 · 0 评论 -
pandas 获取不符合条件/不包含某个字符串的08_Pandas提取含有指定字符串的行(完全匹配,部分匹配)andas多个条件分割字符串,快速提取文件特定行
pandas 获取不符合条件/不包含某个字符串的dataframehttps://blog.csdn.net/weixin_43368684/article/details/88756103?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522160191020319725271751019%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&r原创 2020-10-06 08:17:54 · 1019 阅读 · 0 评论 -
mergejoincontact一对多的解决办法(本质是去重但是要保留特定条件的行)
mergejoincontact一对多的解决办法(本质是去重但是要保留特定条件的行)import pandas as pd #导入pandas库,取别名为pd###left的key没有重复,right的key有重复,:::多对一完全正常left = pd.DataFrame({‘key1’: [‘K0’, ‘K0’, ‘K1’, ‘K2’],‘key2’: [‘K0’, ‘K1’, ‘K0’, ‘K1’],‘A’: [‘A0’, ‘A1’, ‘A2’, ‘A3’],‘B’: [‘B0’, ‘B1’,原创 2020-10-05 23:00:41 · 972 阅读 · 0 评论 -
保留提取重复的数据
pandas 取出dataframe中重复的数据(关于某字段),即去掉不重复的数据https://blog.csdn.net/jasonwang_/article/details/78984852?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-utm_term-6&spm=1001.2101.3001.4242DataFrame中删除重复列(即保留重复列的其中一列)的解决方法https://blog.csdn.net/winner3/arti原创 2020-10-05 22:27:20 · 227 阅读 · 1 评论 -
数据分析(连接df)——使用pandas进行数据处理
https://blog.csdn.net/qq_44032277/article/details/106129955?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-OPENSEARCH-9.nonecase&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-OPENSEARCH-9.nonecasehttps://blog.csdn.net/Yolo_C/article/detai原创 2020-10-05 20:02:08 · 419 阅读 · 0 评论 -
pandas dataframe 根据特定值筛选行的方法dataframe 取行、列 ;及其条件选择
pandas dataframe 根据特定值筛选行的方法应用中偶尔用到筛选dataframe最近找到了个一个很好又自由的方法,df.isin()函数data = df.read_csv(‘test.csv’)筛选不包含0的行data = data[~ data[’col‘].isin([0.0])]同时也可以作为筛选包含0的行data = data[data[’col‘].isin([0.0])]0.0 也可以是任何其他数字或者字符串,并且支持list传入如果需要匹配的话data =原创 2020-10-05 17:29:23 · 6858 阅读 · 2 评论 -
pandas map(), apply(), applymap() 区别解析
pandas map(), apply(), applymap() 区别解析https://blog.csdn.net/weixin_39791387/article/details/81487549?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522160188915719195240457817%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334…%2522%257D&request原创 2020-10-05 17:19:38 · 271 阅读 · 0 评论 -
pandas的DataFrame把几列数据合并成为新的一列
pandas的DataFrame把几列数据合并成为新的一列https://blog.csdn.net/weixin_44084325/article/details/89924330?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522160188315919195246602789%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&reque原创 2020-10-05 17:09:54 · 1286 阅读 · 0 评论 -
python列表切片和嵌套列表取值操作
python列表切片和嵌套列表取值操作https://blog.csdn.net/weixin_38082364/article/details/79833348?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.nonecase&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachi原创 2020-10-05 15:28:56 · 369 阅读 · 0 评论 -
python list 内嵌列表转为一维列表
python list 内嵌列 表转为一维列表https://blog.csdn.net/u010652755/article/details/105549848?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522160188046619195188364090%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&request_id=1601原创 2020-10-05 15:23:06 · 584 阅读 · 0 评论 -
Python中sub()用法Python之正则表达式——查找
Python 字符串操作(string替换、删除、截取、复制、连接、比较、查找、包含、大小写转换、分割等)https://blog.csdn.net/yefengnidie/article/details/6739094?utm_medium=distribute.pc_relevant_t0.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.nonecase&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant_t0.n原创 2020-10-05 13:52:51 · 874 阅读 · 0 评论 -
python提取gtf文件按关键字列表查找并输出其所在行
python按关键字列表查找并输出其所在行https://blog.csdn.net/lh1252969097/article/details/89735025?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.nonecase&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachin原创 2020-10-04 20:38:21 · 1895 阅读 · 0 评论 -
pandas的多列sort二维数组(list与numpy.array)
pandas的sorthttps://blog.csdn.net/weixin_42764612/article/details/101440359?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522160180357019195240458242%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&request_id=16018035701原创 2020-10-04 17:33:16 · 444 阅读 · 1 评论 -
Pandas中loc和iloc函数用法详解Python3 列表,数组,矩阵的相互转换
Pandas中loc和iloc函数用法详解(源码+实例)https://blog.csdn.net/W_weiying/article/details/81411257?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522160178924819195264733043%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334…%2522%257D&request_id=1601789248191原创 2020-10-04 13:37:14 · 1126 阅读 · 0 评论 -
Python3 字典、二维元组、二维列表之间的转化
Python3 字典、二维元组、二维列表之间的转化https://blog.csdn.net/qq_27003337/article/details/105031062?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522160051781119724836746089%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334.pc%255Fall.%2522%257D&request_id=16原创 2020-09-19 20:28:02 · 934 阅读 · 0 评论 -
dict和list相互转换(字典和列表相互转换)
dict和list相互转换(字典和列表相互转换)https://blog.csdn.net/Jarry_cm/article/details/104925292?utm_medium=distribute.pc_relevant_t0.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.nonecase&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant_t0.none-task-blog-BlogCommendFrom原创 2020-09-19 19:52:52 · 560 阅读 · 0 评论 -
python list 内嵌列表转为一维列表
python list 内嵌列表转为一维列表只能是内嵌列表,如果改为 a = [[1,2,3],[4,5,6], [7], [8,9] , 10] 则无法实现import itertoolsa = [[1,2,3],[4,5,6], [7], [8,9]]out = list(itertools.chain.from_iterable(a))print(out)[1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]只能是内嵌列表,如果改为 a = [[1,2,3],[4,5,6], [7],原创 2020-09-19 19:40:28 · 235 阅读 · 0 评论 -
python的读写
import numpy as npimport osdef savetxt(filename,x):np.savetxt(filename,x,delimiter = ‘\t’,fmt=’%s’)#32列list2 = []dict1={}f=open(“C:/Users/dell/Desktop/gasdui.csv”,“r”)lines=f.readlines()for l in lines:line=l.strip().split(",")dict1[line[32]]=lin原创 2020-09-15 20:09:21 · 150 阅读 · 0 评论 -
numpy中的ndarray与pandas的Series和DataFrame之间的相互转换
numpy中的ndarray与pandas的Series和DataFrame之间的相互转换https://blog.csdn.net/jinguangliu/article/details/78538748?biz_id=102&utm_term=pandas%E5%92%8Cnumpy%E6%A0%BC%E5%BC%8F%E8%BD%AC%E6%8D%A2&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2allsobaiduwe原创 2020-08-15 19:50:57 · 1163 阅读 · 0 评论 -
list numpy互相转化
list,tensor,numpy相互转化https://blog.csdn.net/qq_43790749/article/details/100031241?utm_medium=distribute.pc_aggpage_search_result.none-task-blog-2allbaidu_landing_v2~default-1-100031241.nonecase原创 2020-08-14 10:31:07 · 1994 阅读 · 1 评论 -
scanpy画图
###/data/admin/yyp/yypold/scrna/HumanCellAtlasPreviewDatasetsimport numpy as npimport pandas as pdimport scanpy as sc可以直接读取10Xgenomics的.h5格式数据adata = sc.read_10x_h5("/data/admin/yyp/yypold/scrna/...原创 2020-04-18 17:38:07 · 1317 阅读 · 0 评论 -
选择列
选择列df=pd.DataFrame(np.random.rand(3,11),columns=list(‘ABCDEFGHIJK’))df#1pd.concat([df.loc[:‘A’,‘C’],df.loc[:,‘F’],df.loc[:,‘J’:‘K’]],axis=‘columns’)#2df[list(df.columns[0:3])+list(df.columns[5])...原创 2020-04-14 14:16:40 · 178 阅读 · 0 评论 -
python.query()函数
#使用python.query()函数对数据框进行(挑选行)的操作import pandas as pdd={ 'name':['a','n','c','d','e','f'], 'Gender':['male','female','male','male','female','female'], 'age':[23,24,24,22,21,20], 'hig...原创 2020-04-14 13:40:29 · 27349 阅读 · 1 评论 -
dfply
from dfply import data diamonds = data.diamonds import pandas as pdprint(diamonds.loc[:,['cut','price','x']].head(3)) print('------------------------------------------') print(diamonds[['cut...原创 2020-04-14 09:39:17 · 583 阅读 · 0 评论 -
pandas—数据处理01目录
https://blog.csdn.net/qq_42631853/article/details/102824512原创 2020-04-13 20:50:34 · 76 阅读 · 0 评论 -
python练习题
‘’’生信练习题:调整GFF文件中的坐标位置需要对AUGUSTUS得到GFF文件进行处理,将原来的chr8:25234310-25266151替换成chr8,将坐标2896根据我们提取序列的起始位置进行调整,也就是25234310 + 2896 -1。测试数据可以从这里下载(链接:https://share.weiyun.com/5E3Gk2u 密码:zxe3q4)请使用拿手的工具写一段代...原创 2020-04-09 15:23:25 · 145 阅读 · 0 评论