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原创 AMBER“unit charge = 12; ion1 charge = 1; can‘t neutralize.“
AMBER"unit charge = 12; ion1 charge = 1; can't neutralize."
2022-10-09 17:44:31 198 1
原创 AMBER“FATAL: Atom .R<SEP 552>.A<N 1> does not have a type.“
FATAL: Atom .R.A does not have a type
2022-10-09 17:23:28 1241 2
原创 Autodock分子对接详细步骤
Autodock蛋白配体对接主要包括两部分:一是蛋白和小分子配体的预处理。二是蛋白和配体对接。其详细步骤及注意事项如下。一、蛋白和配体预处理1.小分子预处理:1.1 下载:ZINC或TCMSP官网下载小分子mol2格式,用pymol打开保存为.pdb格式。1.2 预处理:使用autodock预处理小分子。步骤:读入小分子:Autodock→file→read molecule (导入小分子pdb文件);加氢:edit→hydrogens→add;计算电荷:edit→charge→comput
2022-09-08 09:53:53 5789
空空如也
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