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RSS订阅原创 Python pandas 染色体 SNP 位点提取 并排序
import pandas as pdfrom pandas import DataFrame as dff = open('C:\\Users\\windows10\\Desktop\\Python练习\\文本流\\1177genetype_hapmapcp1_18_01.txt')d0 = pd.read_table(f, sep = "\t") #header 默认为第一行d0.s...
2018-11-29 00:17:51
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原创 Python csv 两种方法 实现 碱基合并 pandas
import csvf = open("C:\\Users\\windows10\\Desktop\\Python练习\\文本流\\raw循环合并.csv")csv_reader = csv.reader(f,dialect='excel') # dialect='excel'为EXCEL编码风格，否则无法读取首行li = [] #避免list，str等系统字眼lis ...
2018-11-23 07:13:22
448
原创 Python csv 文件读取 打印
方法一： import csv f = open("C:\\Users\\windows10\\Desktop\\Python练习\\文本流\\raw循环合并.csv") csv_reader = csv.reader(f,dialect='excel') # dialect='excel'为EXCEL编码风格，否则无法读取首行 for line i...
2018-11-23 05:29:58
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原创 Linux 文本处理 sed sort awk
less -S text # 原格式显示 sort -n -k2 -k4 1.map > 2.map # 排序，-n 依照数字顺序，-k 列数wc 1.map # 统计文件的行数，字符串数，字节数cat 1.map | awk '($1 =="1"){ print}' # 读取文件并抽取第一列awk '{print $1 " " $4}'
2018-11-19 23:05:27
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原创 Linux 文本 sed 命令 碱基对 替换
sed -i 's/AA/11/g' data3.txt # -i 为替换原文本并替换原文本，而不用重新输出 # s为文本替换命令 # AA为要替换的内容 # 11为替换的内容 # g代表作用于文件文本全文 # data3.txt 为目标文件...
2018-11-18 11:37:02
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翻译 Python批量爬取堆糖网图片
import urllib.parseimport requests #第三方请求库import json import jsonpath #处理json文件的的提取库from bs4 import BeautifulSoupimport osimport urllibimport re label = 'AI'label = urllib.parse.quo...
2018-11-11 11:30:27
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翻译 利用Python批量爬取XKCD动漫图片，并批量保存
import requests, os, bs4url = ‘https://xkcd.com’os.makedirs(‘xkcd’,exist_ok = True)while not url.endswith(’#’):# download the pageprint('downloading the %s...'%(url)) # '%s...'%(url)对字符串及进行替换re...
2018-11-10 16:37:36
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原创 Python 利用BeautifulSoup和正则表达式 来爬取旅游网数据
import reimport requestsimport timefrom bs4 import BeautifulSoupurl = ‘http://www.cntour.cn/’r = requests.get(url)print(r.encoding,len(r.text))soup = BeautifulSoup(r.text, ‘lxml’)data = soup.s...
2018-11-09 21:49:23
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原创 Python 爬虫 爬取单个基因 表格数据的生物学功能 （urllib+正则表达式）：
Python 爬虫 爬取单个基因的生物学功能（urllib+正则表达式）：import reimport urllibfrom urllib import requesturl = ‘https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=NCOA1’response = urllib.request.urlopen(url)content = respon...
2018-11-08 12:55:39
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空空如也
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