《医学图像处理及三维重建技术研究》
python三维建模包
FreeSurfer
解析:FreeSurfer是一个处理大脑3D结构像数据,进行自动皮层和皮下核团分割的软件。该软件是一款用于分析脑神
经数据的工具集合,它提供了一系列的算法来量化人脑的功能、连接以及结构属性,能对高分辨率的磁共振图像进行
三维重建,生成展平或胀平图像,并能得到皮质厚度、面积、灰质容积等解剖参数。
FreeSurfer安装,如下所示:
(1)配置环境变量
export FREESURFER_HOME=/home/ssw/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
(2)yum install tcsh
(3)将license复制到/home/ssw/freesurfer中。
(4)分别输入tkregister2、tkmedit、tksurfer 和recon-all --help。
(5)recon-all -s bert -autorecon1。
Slicer
解析:3D Slicer是一个跨平台的,免费和开源的数据可视化和医学图像计算软件包。
nipy,nibabel
解析:Python医疗影像开发包。pip install nipy-0.4.0-cp27-none-win_amd64.whl;pip install nibabel。
VTK
解析:VTK(visualization toolkit)是一个开源的免费软件系统,主要用于三维计算机图形学、图像处理和可视化。
VTK是在面向对象原理的基础上设计和实现的,它的内核是用C++构建的,包含有大约250,000行代码,2000多个类,还包含有几个转换界面,可以通过Python语言使用VTK。