恒星演化模拟神器——mesa安装教程

mesa介绍

  在前面（停更之前）已经介绍了恒星的四个静力学平衡方程以及化学成分演化方程，将这五个方程结合起来，并加上恒星的初始条件以及边界条件，就可以使用数值模拟的方式去模拟恒星的演化了

  mesa（Modules for Experiments in Stellar Astrophysics）便是一个实现了上述功能的软件，有了这个软件，就不需要再自己专门花时间去探究数值模拟中的各种问题了。这个软件既可以模拟单个恒星在各个阶段的演化过程，也可以模拟各种双星系统的演化。除了用户自定义配置外，mesa还提供了大量的不同演化情形下的模板（例如前主序的演化、低质量恒星从前主序到白矮星、高质量恒星从前主序到铁核坍缩……），这样就省去了用户挨个设置参数可能会耗费的大量时间和精力

  除此之外，对于mesa输出的各种数据文件，都可以用官方提供的、在Python上运行的mesa_reader模块（下载链接：https://github.com/wmwolf/py_mesa_reader）去读取，这样就可以很方便地对输出的数据进行更好、更自由的分析以及可视化处理：

video_M_12_Z_0p02_m

video_M1_9_M2_5

  但是，mesa的安装却似乎不是一件特别容易的事。尽管在官网上也有详细的教程（链接：https://docs.mesastar.org/en/release-r21.12.1/installation.html），但在安装的时候也总会遇到各种各样的问题。在先后给不同的环境安装了三四次mesa后，我决定总结出一种尽可能地将各种可能遇到的坑绕开的安装方法

mesa的安装

安装必备库——mesa SDK

  mesa的安装和运行需要许多库（以fortran为主）的支持，这些库官方都打包在了mesa SDK中。因此在安装mesa前，需要先安装这些必备的库

  首先，使用包管理器（ArchLinux亲测可以直接通过包管理器安装）或在官网（链接：http://www.astro.wisc.edu/~townsend/static.php?ref=mesasdk#linux-download）下载mesa SDK，将其放在任意路径，随后编辑本地配置文件（对于使用默认的bash shell的用户，这个文件是~/.bashrc，而如果使用的是zsh shell，则对应的是~/.zshrc，以此类推，后面都默认用户使用的是~/.bashrc，如有不同可以自行修改），在里面设置路径变量，并再添加一行初始化mesa SDK的命令（初始化的时候会自动将路径添加到$PATH变量中，所以不用再单独手动设置$PATH）。以本人的下载地址/opt/mesasdk为例：

# you should have done this when you set up the MESA SDK
export MESASDK_ROOT=/opt/mesasdk
source $MESASDK_ROOT/bin/mesasdk_init.sh

  （设置结束后需要source ~/.bashrc或重启命令行以使得改动生效，下同）

  至此，必备库的安装便完成了，接下来便是mesa的安装

安装并配置mesa

  mesa这个软件可以直接从官网上的release中进行下载（链接：https://zenodo.org/record/5798242#.YfnrbltByCg），下载解压后，也是可以放在任意路径下，随后将这个路径添加到~/.bashrc中（假定安装在目录/home/abc/def/mesa下），并设置最大占用核数（这个可以根据自己的需求或机器的情况调大一些，也可以不设置，但如果不设置，在运行的时候就会占满所有的核，当时我就把服务器的104个核全占满了……）：

# set MESA_DIR to be the directory to which you downloaded MESA
export MESA_DIR=/home/abc/def/mesa

# set OMP_NUM_THREADS to be the number of cores on your machine
export OMP_NUM_THREADS=2

  设置完成后，就可以开始安装了。分别按下述指令依次操作，即可完成安装：

cd $MESA_DIR
./install

  如果仍有报错，则需要检查一下$PATH、$LIBRARY_PATH和$LD_LIBRARY_PATH这几个变量，看看是不是有什么包含了fortran库的路径被放在了mesa SDK库的前面，或者是mesa SDK没有被放进去（这里确实比较玄学……）

  如果想要重新安装，则可以先clean再重新install：

cd $MESA_DIR
./clean
./install

  正常情况下，等上几分钟到数十分钟就可以完成安装，完成后就可以开始按照官网的教程一步一步地进行学习了

mesa的各种使用方法

  关于mesa这个软件的使用方法，官网上有非常详细的教程，可以直接参考链接：https://docs.mesastar.org/en/release-r21.12.1/using_mesa.html