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基因组组装
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沐雨@
生物信息学,邮箱charles_kiko@163.com备注基因组
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生信人填坑记 orthofinder的安装和基础使用
其中常用的有两个结果,第一个是Orthogroups文件夹下的Orthogroups.GeneCount.tsv,这个文件里保存着每个家族在每个物种里的成员数量。(写到这儿饭点到了,吃饭要紧…在国内使用conda的同学我相信很多人都会遇到-|- -|- -|- -|- -|- -|- -|- -|- 一直转圈。软件的是由很简单,将你要跑的物种的蛋白质文件放在work/data目录下,文件名都用物种缩写,后缀统一就行。当然,很多软件都会自带一个这样的文件,conda装不了的时候可以去软件官网溜达溜达。原创 2023-10-10 13:22:11 · 1555 阅读 · 1 评论 -
canu/hifiasm进行HIFI数据初步组装示例
HIFI基因组初步组装原创 2023-04-13 00:48:06 · 1008 阅读 · 0 评论 -
生信人迷惑的一天 bam转fq
bam格式转fastq的二三事原创 2022-07-22 14:08:45 · 1350 阅读 · 1 评论 -
生信人的一天~HIFI数据+HIC数据组装基因组
HIFI+HIC数据组装基因组!原创 2022-07-21 16:47:29 · 5672 阅读 · 8 评论