Fiji/ImageJ的使用

最新推荐文章于 2024-08-08 20:19:50 发布
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x.1 将lif文件选取特定stack后转为灰度图再存成image sequence

ctrl + i: 查看文件信息

  1. 下载最新版本ImageJ（我的是ImageJ 2.14.0），导入lif文件，选择你需要处理的series；

  2. Image - hyperstacks - stack to hyperstacks，参数默认生成hyperstack；??这一步的作用是什么，为什么要生成hyperstacks？

  3. 拖动slice参数和channel参数，挑选好你需要的slice number；右键-duplicate-输入slice

  4. 选择两个channel，都使用LUT - gray转为灰度图；

  5. File - save as - image Sequnce存储图片

樱木之
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Fiji（Fiji is just ImageJ）
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ImageJ是一款基于JAVA开发的图像处理工具，Fiji（Fiji is just ImageJ）集成了更强大的图像处理功能。版本为windows 64位。
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Fiji/ImageJ调整图像的对比度；Fiji/Image查看图像的像素直方图分布
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很多ImageJ/Fiji的问题用中文查不到，尽早尝试用英文去搜索！！！！！！！！ 下面记录两个小功能，以及英文教程和imageJ写脚本的教程。 调整图像对比度 Step1：打开一张图像。比如我的一个tif图特别暗，就可以调一调对比度 Step2:调整对比度 使用快捷键：Ctrl+Shift+C 或者：Image—>Adjust —>Brightness/Contrast 得到下面这个调节框，然后一般点击Auto就可以了，也可手调 查看图像的像素直方图分布 Step1:打开一张图像
图像与像素：利用ImageJ分析荧光显微镜图像｜QuPath基础教程1｜24-08-08
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Fij/imageJ下载使用
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imageJ不用安装，直接下载压缩包解压就可以 推荐可以看下这个博主的讲解，很详细。 https://zhuanlan.zhihu.com/p/54955448 1.下载 下载网址： 2.如何选取一个堆栈tiff 文件中的某一段，并将之保存为单独的一张图片 1.选取特定片段 工具栏——Image——Stacks——Tools——Make Substack— （在对话框Slices中写入特定片段页数...
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