超详细Windows 10 Cytoscape安装教程

已于 2023-03-27 12:29:04 修改
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分类专栏： 各类软件安装配置合集 文章标签： java
于 2022-04-09 17:23:16 首次发布
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一、Cytoscape下载

首先打开Cytoscape官网，官网首页地址为
Cytoscape官网首页地址

点击Download
在这里插入图片描述

注意！！！安装Cytoscape 3.9.1需要有Java 11（JDK 11）版本的支持，若你的电脑未安装配置JDK或安装的就是JDK 11版本的，那么就可以安装此版本Cytoscape（未安装JDK的不用担心，下载Cytoscape会自动下载相应的OpenJDK，只需要在安装Cytoscape之前安装好伴随的OpenJDK即可，若不会操作，可上网先自行安装配置JDK 11，网上有相应的安装配置JDK 11的安装教程）
若本身安装的是JDK 8版本的也不用担心，找到以前支持JDK 8版本的即可，笔者安装配置的为JDK 8版本，所以接下来点击Old Versions。
Cytoscape新旧版本的安装步骤是几乎一样的，这点大家不用担心！

在这里插入图片描述

若是不清楚自己本身的JDK是什么版本的，按WIN+R键调出运行窗口，输入cmd按回车，调出cmd窗口
在这里插入图片描述

输入java -version按回车即可查看到自己的JDK版本

java -version

在这里插入图片描述

点击Old Versions后进入如下页面
在这里插入图片描述

至于如何查看Cytoscape版本所需求的最低JDK版本，请看若下图所示
随意点击一个Cytoscape版本，例如3.7.0版
在这里插入图片描述

再次点击Code
在这里插入图片描述

下滑至Requirements即可看到此版本要求的最低JDK版本配置，其他版本同理，在此笔者不再一一展示
在这里插入图片描述

由于笔者的JDK版本是JDK 8，因此笔者在此下载的是3.7.2版本，点击3.7.2版本
在这里插入图片描述

由于笔者的电脑是Windows 64bit的，因此笔者选择下载如下图所示exe文件，点击之后即可开始下载，等待下载完成即可！
在这里插入图片描述

二、Cytoscape安装

下载完成后会得到如下图所示exe文件，双击此exe文件，即可开始安装
在这里插入图片描述

点击Next
在这里插入图片描述

点击I accept the agreement之后点击Next
在这里插入图片描述

选择你想要安装的位置之后点击Next，笔者在此将之安装在D盘
在这里插入图片描述

点击Next
在这里插入图片描述

点击Next
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等待安装
在这里插入图片描述

点击Finish
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三、打开Cytoscape

在这里插入图片描述

在这里插入图片描述

OK！至此，Cytoscape安装成功！

极小白
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Cytoscape安装及使用
weifanbio的博客
04-13 3万+
最近小编在使用Cytoscape软件，觉得真不错，哈哈，以下是关于此软件简单的安装和使用方法，觉得有用的小伙伴可以看看。 一、Cytoscape简介 Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。Cytoscape 源自系统生物学，用于将生物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他的分子状态信息整合在一起，其最强大的功能还是用于大规模蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA和遗传交互作用的分析。 通过Cytoscape，可
cuda install； ubuntu22安装nvidia驱动 以解Cytoscape3.10找不到libOpenCL.so错， Cytoscape3教程
_
12-25 754
cuda install； ubuntu22安装nvidia驱动 以解Cytoscape3.10找不到libOpenCL.so错， Cytoscape3教程
Cytoscape3.7.1安装包
09-09
Cytoscape是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。Cytoscape源自系统生物学，用于将生物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他的分子状态信息整合在一起，其最强大的功能还是用于大规模蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA和遗传交互作用的分析。通过Cytoscape，可以在可视化的环境下将这些生物网络跟基因表达、基因型等各种分子状态信息整合在一起，还能将这些网络跟功能注释数据库链接在一起。Cytoscape的核心是网络，简单的网络图包括节点（node）和边（edge），每个节点可以是基因、miNRA或蛋白质等等；节点与节点之间的连接 (edge) 代表着这些节点之间的相互作用，包括蛋白与蛋白相互作用（pp），DNA与蛋白相互作用（pd）等。
Cytoscape 3.7.2 windows系统
11-07
Cytoscap是免费的用于绘制网络的软件，官网为https://cytoscape.org/，但是国内用户下载速度堪忧，并且很可能容易中断，这里分享到CSDN供大家下载。 Cytoscape is an open source software platform for visualizing molecular interaction networks and biological pathways and integrating these networks with annotations, gene expression profiles and other state data.
cytoscape使用教程
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m0_65188455的博客
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cytoscape使用教程，记录学习内容
Cytoscape软件下载、安装、插件学习[基础教程]
BioinfoDu
11-29 3558
对于做组学或生物信息学的同学基本是陌生的，可能有的同学用这个软件作图是非常溜的，做出来的网络图也是十分的好看，“可玩性”很高，就像前面分享的aPEAR包一样。，主要发表或收录生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；随后，在社群咨询，各位同学也给出目前各自正常使用的版本。今天分享的内容是自己遇到问题后，咨询社群里面的同学，帮忙解决的总结。由于最新版本，有同学反应无法下载插件，我们在这里就不安装最新的版本。自己在前面写论文的时候也是一直在使用，以前使用的版本是。
Cytoscape软件的基本使用
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Cytoscape是一款开源软件，可以用于可视化网络和分析。接下来将简单介绍软件的安装与使用。Cytoscape官网。
互作网络可视化-Cytoscape简单教程
almostfullmoon的博客
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目录 零、数据准备 1、二维关系表一维化 2、关注基因制表 3、属性文件 一、数据导入 二、图的筛选 三、图的布局 四、设置图中节点与边的样式-以及根据值大小调整 根据值相关性调整 五、图放大缩小-旋转 ​ 零、数据准备 1、二维关系表一维化 这是原表，展现菌群与样本之间的相关性的二维表 可用power query进行逆透视化，office2019已经集成在程序内 一维化结果二维表转一维表，需要选择除第一列以外的列，然后点逆透视 产生的一维表，就是包含两个节点，..
Cytoscape网络可视化 | 以WGCNA结果的网络可视化为例
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Cytoscape网络可视化 | 以WGCNA结果的网络可视化为例 Cytoscape是一个开源的软件平台，用于可视化分子相互作用网络和生物路径，并将这些网络与注释、基因表达谱和其他状态数据进行整合。虽然Cytoscape最初是为生物研究设计的，但现在它是一个复杂网络分析和可视化的通用平台。Cytoscape核心版提供了一套基本的数据整合、分析和可视化功能。 额外的功能...
cytoscape教程
10-23
cytoscape教程，简单协助应用该教程进行绘图，可将可视化图片设置成想要的效果，易学实用。
cytoscape.js
03-06
cytoscacpe.js是一个网络图的可视化开源JavaScript库，可以可视化大量的生物分子/基因等，通用性强，可被其他领域用来做网络的可视化和分析。
Cytoscape_3_8_0_windows_64x安装足够用.zip
08-28
sytoscape软件安装包，JAVA软件安装包，包括安装方法，绝对省时省力。sytoscape软件是强大的生信分析软件，但是在安装使用的过程中，由于需要JRE运行环境。sytoscape_3_8以上版本，需要最低配置的jre11，需要安装JDK...
Cytoscape3.10.2安装教程
2401_84164100的博客
04-10 491
2.双击打开"OpenJDK17U-jdk_x64_windows_hotspot_17.0.10_7"8.双击打开“Cytoscape_3_10_2_windows_64bit.exe”1.选中下载好的安装包，右键选择解压到“Cytoscape3.10.2”文件夹。10.勾选“I accept........”，点击“Next”11.选择安装路径，点击“Next”（建议和我的路径保持一致）4.选择安装路径，点击"下一步"12.点击“Next”13.点击“Next”9.点击“Next”
Cytoscape安装教程
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下载Cytoscape，准备对应版本的Java JDK 官网：https://cytoscape.org/ Cytoscape基于Java Java JDK 环境配置这里就不说了 安装Cytoscape 1、选择JDK 2、继续安装 3、选择安装目录 4、创建桌面图标 5、默认 安装完成 ...
cytoscape插件下载_利用Bingo(Cytoscape插件)进行GO功能富集分析
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点击上方「蓝字」关注我们“转录组分析中基因的GO富集分析这步有很多软件可以选择，这次我们来介绍下如何利用Cytoscape软件中的一个简单又好用的Bingo小插件完成富集的工作，Cytoscape其实是一个做网络图的软件，所以使用Bingo的这种方法特别之处就在于富集的结果是可以直接以网络图的形式呈现，类似于下图这种效果，区别于其他的软件大多只会给出一个富集结果的表格。示例操作步骤：Cy...
Cytoscape安装后无法打开
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Cytoscape是一款图形化显示网络并进行分析和编辑的软件，从官网下载了最新的版本 3.7.2，安装好软件后无论怎么点击都没有反应，没有任何窗口弹出或提示出现。
用html+css写一个美观的登录和注册页面
09-14
### 回答1： 答：使用HTML和CSS编写美观的登录和注册页面需要一定的技术技巧。首先，应该根据用户的需求来设计页面，以确保其显示效果良好。其次，要设计出合理的HTML结构，以便在CSS中进行合理的布局。此外，还可以利用CSS中的样式属性，如字体、颜色和背景等，使页面更加美观大方。 ### 回答2： 要用HTML和CSS写一个美观的登录和注册页面，我们可以遵循以下步骤： 1. 创建HTML结构： 在<body>标签中，创建一个<div>元素，并给它一个唯一的id，例如：id="container"。在这个容器中，我们将添加登录和注册表单。 2. 设计登录表单： 在容器内，创建一个<form>元素，用于登录表单。在表单内，添加需要的输入字段，例如用户名和密码。为每个输入字段添加<label>标签，并使用<input>元素为输入字段提供输入。 3. 设计注册表单： 与登录表单类似，再在容器内添加一个新的<form>元素，用于注册表单。添加所需的输入字段，例如用户名、电子邮件和密码，并为每个字段添加<label>标签和<input>元素。 4. 使用CSS样式美化页面： 使用CSS来增加样式和外观。为容器添加背景颜色、内边距和外边距以及边框。对于表单元素，设置宽度、高度、内边距、外边距和边框样式等。还可以添加阴影效果、悬停效果和动画效果，以增强页面的美观性。 5. 设置页面布局和排列： 使用CSS布局属性，如flexbox或grid，来确定表单元素的布局。可以设置表单元素按行或按列排列，并使用适当的间距和对齐方式。 6. 添加按钮和链接： 为登录和注册表单添加按钮，使用<button>元素，并为按钮添加样式。还可以添加从登录表单跳转到注册表单的链接，使用<a>元素，并通过CSS样式为链接提供效果。 7. 响应式设计： 使用CSS媒体查询，对页面进行响应式设计，以使其在不同设备上显示良好。可以针对较小的屏幕大小调整表单的布局和样式。 通过这些步骤，我们可以使用HTML和CSS创建出一个美观的登录和注册页面。 ### 回答3： 登录和注册页面是网站或应用程序中非常重要的组成部分，它们的设计应该既美观又易于使用。以下是用HTML和CSS写一个美观的登录和注册页面的基本步骤： 1. 创建HTML结构：使用HTML标记创建需要的元素，如表单、输入框、按钮等。可以使用<div>、<form>、<input>等标签来定义不同的元素。 2. 添加样式：使用CSS样式来美化页面。可以设置背景颜色、边框样式、字体样式、间距等。可以使用ID或类选择器来选择特定的元素，并设置相应的样式属性。 3. 设计登录页面：添加登录表单，可以包含用户名、密码和登录按钮。可以使用表单验证功能来确保输入的准确性。 4. 设计注册页面：添加注册表单，可以包含用户名、密码、确认密码和注册按钮。可以使用JavaScript或服务器端验证来确保密码的一致性。 5. 设置响应式设计：使用CSS媒体查询来确保页面可以适应不同的设备和屏幕尺寸。可以设置不同的布局和样式，以便在手机、平板电脑和桌面上都能提供良好的用户体验。 6. 添加动画和过渡效果：使用CSS动画和过渡效果来增强用户交互体验。可以为输入字段添加焦点和悬停样式，以及过渡效果来改变元素的状态。 值得注意的是，这只是基本的步骤，根据具体需求和设计风格，可以进一步优化和添加功能。通过合理的布局、配色方案和良好的用户体验，我们可以创建一个美观而实用的登录和注册页面。

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