BrainNet Viewer绘制脑网络教程

＾哪来的＆永远～

已于 2023-11-24 11:04:53 修改

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文章标签： matlab

于 2023-11-24 11:04:36 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_45538220/article/details/134594018

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BrainNet Viewer使用说明和画图实践

txapples的博客

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文章目录一、BrainNet Viewer简介二、使用1.下载安装2.Option setting三.实践一、BrainNet Viewer简介 BrainNet Viewer是一个用于人脑连接的网络可视化工具。需要导入四种类型的导入文件brain surface、node、edge和volume文件。 brain surface脑表面文件。brain surface文件是一个以’ nv ‘为后缀的ASCII文本文件，包含四个字段:顶点的数量、每个顶点的坐标、三角形面的数量和组成三角形的顶点的索引。使

使用BrainnetViewer展示脑连接（包括制作edge）

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实际上用BrainNetViewer来展示连接或脑区的人已经越来越少了，因为一旦连接增多，表示就非常不清晰。但作为一个经典的软件，还是有必要去了解。配置就不多说了，直接进入正题点击load file:可以看到有四个可以导入文件的地方。

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选一个模板，脑子的背景图，我用的152_smoothed。以在neurosynth下载的motor网络为例。Mapping file选已有的特定网络nii。Matlab命令行输入BrainNet回车。可以适当调节区间范围，让图看起来好看点。

BrainNet viewer使用

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开始使用时在matlb里输入 BrainNet。这里要注意虽然这个软件名字叫brainnet viewer，但是一定要输入BrainNet，一旦你加了viewer就会报错。。。。

BrainNet Viewer教程——大脑可视化

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BrainNet Viewer包以及文章中所用到的代码和文件可以关注公众号【大脑探路者】回复【大脑可视化】下载。文章教程包括使用示例数据画节点图和边图，以及如何用自己的数据画节点图和边图。

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L2016163123的博客

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一、安装（1）该工具包是由北京师范大学贺永老师课题组开发工具包下载地址：NITRC: BrainNet Viewer: Tool/Resource Info （2）工具包下载完成后解压并复制到matlab的相应目录下（3）打开matlab>设置路径>按如下操做（4）在命令行窗口输入>BrainNet 即可进入二、使用（1）加载文件:File>load File>加载不同的文件，这些文件不需要都加载加载一个也可展示例如：添加s..

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### 关于BrainNet Viewer Node文件的使用 Node文件对于BrainNet Viewer来说至关重要，因为这些文件定义了网络分析中的节点位置和属性。为了创建并使用适用于BrainNet Viewer的`.node`文件，通常遵循特定结构来描述脑区的位置及其标签。 #### 创建自定义 `.node` 文件当创建一个用于BrainNet Viewer的`.node`文件时，比如基于AAL2模板[AAL2.node][^1]，该文件应当包含如下信息： - **列数**：至少有四列，前三列表示三维坐标(x, y, z)，最后一列为区域名称或编号。 - **格式**：每一行代表一个单独的节点，即一个具体的解剖学上的兴趣点(ROI)。例如，下面是一个简单的`.node`文件片段： ```plaintext 78.0 -36.0 42.0 Frontal_Sup_L 54.0 -18.0 48.0 Frontal_Inf_Oper_L ... ``` 上述例子展示了两个左半球额叶下回的操作部(Frontal Inf Oper L) 和上回(Sup L) 的坐标以及对应的命名。 #### 加载Node文件到BrainNet Viewer 要将准备好的`.node`文件加载至BrainNet Viewer中，需按照以下方式操作：启动MATLAB环境，并确保正确调用了`BrainNet`命令而不是带有Viewer后缀的形式[^3]。接着通过菜单栏或者脚本形式指定路径指向所需的`.node`文件作为节点数据源(Data file (node))。这一步骤同样适用于其他类型的输入文件如Edge文件等。此外，在配置过程中可以选择不同的表面模型（Surface File），例如常用的ICBM152标准空间下的脑网格模板(BrainMesh_ICBM152.nv)[^5]。完成设置之后点击确认按钮即可展示相应的神经网络图像。