pymatgen安装与测试代码

1. 通过conda安装pymatgen

1.1安装conda软件

我装的是anaconda

1.2安装pymatgen

安装完conda，开始使用conda安装pymatgen。可以给pymatgen创建一个专门的conda环境：

$ conda create -n my_pymatgen python # 创建虚拟环境my_pymatgen
$ conda activate my_pymatgen  # 激活虚拟环境
$ conda install --channel conda-forge pymatgen

如果上面的失败，尝试运行：

conda install --yes numpy scipy matplotlib
pip install pymatgen

pymatgen版本更迭很快，基本上每个月都会更新，而且有时更新后会不支持之前的代码，可以使用下面的命令更新：

$ conda upgrade pymatgen

2. 使用pip安装pymatgen

pip安装比较简单，只需要一行命令：

$ pip install pymatgen

更新的话使用命令：

$ pip install --upgrade pymatgen

要使用一些功能的话仍然需要安装相应的软件包：

$ pmg config --install enumlib$ pmg config --install bader

安装成功后，测试代码：

需要先去materials project注册账号，然后点击API，API keys里面就有秘钥

"""
功能描述：获取Materials Project的数据测试代码，需要到Materials  project官网注册账号，获取密钥
"""
from pymatgen.ext.matproj import MPRester

API_KEY = '密钥'  # Materials  project官网，账号注册后提供的密钥

def que_p(target):  # 分子式，比如Fe2O3
    api_res = MPRester(API_KEY)
    data = api_res.get_data(target, data_type='vasp')
    return data

print(que_p('Fe2O3'))#正常打印数据就表示ok！

 如果出现类似于这种问题，可能是numpy版本不兼容，版本可能过低，试试更新一下numpy

ValueError: numpy.ndarray size changed, may indicate binary incompatibility. Expected 96 from C header, got 88 from PyObject

总结转自pymatgen的安装与使用 - 知乎 (zhihu.com)

Installation — pymatgen 2022.7.8 documentation

CI failing because of compilation issue of `pymatgen` · Issue #5293 · aiidateam/aiida-core · GitHub

materials project之pymatgen环境配置 - 壶小旭 - 博客园 (cnblogs.com)