Biobank genetic data探析（三）

最新推荐文章于 2024-05-29 09:10:52 发布
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分类专栏： GWAS自学历程 文章标签： 大数据
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本文链接：https://blog.csdn.net/qq_45899165/article/details/126386418
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本文详细介绍了Biobank遗传数据的基因分型过程和样本质量控制，包括Affymetrix的质控指标、DNA浓度、性别推断等。在进行遗传学分析前，样本质量控制至关重要，如性别一致性、遗传亲缘关系、民族群体划分等，以确保研究的准确性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Biobank genetic data探析（三）——Genotyping process and sample QC

一. 总览

  • Category 100313
  • 这类数据包含了Affymetrix做Genotype calling的pipeline的流程信息（后续分析中可能用不到），以及样本质量控制的信息（下游分析中估计是必用了）。

二. 数据集描述

2.1 Genotyping process

查看之后发现这部分不是很重要，毕竟genotype call和imputation数据我们都有了，放一些官方描述心中大致有个数。

2.1.1 Genotype measurement batch
  • UKbiobank链接
  • 数据是按批次发出来的，每批次大概3700人，不是很重要的信息。
2.1.2 Genotype measurement plate
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