python版本3.7情况下安装rdkit，torch_geometric，numpy的过程

前言

在上一篇中，我是在anaconda自带的python3.9的环境下安装的torch_geometric，相对来说步骤比较少，一个下午就安装好了，但是在最近接触的一篇论文中需要用到rdkit这个包，我尝试在这个虚拟环境下安装，但是出现了如下提示，表示此包和python3.9不适配

- rdkit -> python[version='2.7.*|3.5.*|3.6.*|>=2.7,<2.8.0a0|>=3.5,<3.6.0a0|>=3.6,<3.7.0a0|>=3.7,<3.8.0a0|3.4.*']

所以我又重新建了一个虚拟环境 haveRDKit，准备使用python3.7环境，并且也需要torch_geometric，numpy包。所以又经过令人头秃的学习和试验之后，终于安装好了

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正文开始

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第一步：新建虚拟环境

在base环境下新建环境时候要标明使用的python版本，本次使用的是python3.7,并且我的环境名字叫haveRDKit

conda create -n haveRDKit python=3.7

第二步：配置pytorch环境（从这步开始就都要在虚拟环境haveRDKit下操作）

在配置之前先要了解自己的cuda版本等知识。配置pytorch环境可以参考之前我的这篇文章Anaconda Pycharm Pytorch（GPU版本）的配置_pytorch gpu版本_CWQF-T的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/qq_46080349/article/details/128054938?spm=1001.2014.3001.5501

此次要配置python3.7环境，我使用的是CUDA 11.3版本对应的pytorch、torchvision、torchaudio、 cudatoolkit包（大家可以从网上找python和cuda、pytorch、torchvision、torchaudio、 cudatoolkit等的对应关系，也可以参考我的文章CWQF-T的博客-CSDN博客）。我使用的代码如下：

conda install pytorch==1.10.0 torchvision==0.11.1 torchaudio==0.10.0 cudatoolkit=11.3 -c pytorch -c conda-forge

第三步：直接安装rdkit

在此虚拟环境中直接输入如下代码：

conda install -c conda-forge rdkit

一般情况下就能直接安装成功。判断方法：输入conda list，看是否有rdkit包

如上图就表示安装成功！并且说明我的版本是2022.03.5的 

第四步：安装torch_geometric

可以参考我的这篇文章安装torch_geometric_torch_geometric安装_CWQF-T的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/qq_46080349/article/details/129737928?spm=1001.2014.3001.5501

我按照这个步骤安装，下载的四个包如下所示：

安装过程如下：

接下来应该就是执行安装torch_geometric 的命令了，但是此时开始了噩梦

输入安装命令之后出现了一堆有颜色的语句，说明出错了，我查找了资料，觉得可能是镜像源的问题，所以指定了一下路径（代码如下），就成功了！

pip install torch-geometric -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/ --trusted-host pypi.tuna.tsinghua.edu.cn

下图显示了我安装的包的信息： 

但是：在依据上述文章的语句对此包进行测试的时候 又又又出现了问题！！我分了两张图片表示

第一张表示numpy包出现了问题

第二张表示需要C扩展（查了资料，这个所谓的C扩展在此是指python与C进行了结合吧啦吧啦），并且也表示numpy有问题

解决C扩展很简单，直接输入如下语句安装一下即可

pip install Cython

接下来解决numpy的问题

第五步：安装numpy

先把路径切到G:\Software\Anaconda3\envs\haveRDKit下，具体方法在下面的文章里面有！！！安装torch_geometric_torch_geometric安装_CWQF-T的博客-CSDN博客https://blog.csdn.net/qq_46080349/article/details/129737928?spm=1001.2014.3001.5501

首先，我到此虚拟环境下的包里找了，确实没有numpy包，于是我试了网上的办法，试着直接把其他虚拟环境下python的numpy包复制到此虚拟环境的\Lib\site-packages目录下，但是发现没用（我的路径是G:\Software\Anaconda3\envs\haveRDKit\Lib\site-packages）。

而且如果直接安装numpy可能会出现如下问题（有的朋友如果可以直接安装成功的话就可以跳过这一步）

这表示要安装的numpy包和其他包之间有了冲突

于是我又尝试指定numpy的版本来安装，如下所示

于是我按照提示的办法，打开了anaconda的官网，搜索numpy，如下所示，点击自己需要的版本即可。我点的是1.21.6。

点开之后就是下图这样，直接复制命令并且在anaconda prompt里执行 

执行结果如下： 

表示下载成功！！！

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执行之后需要测试一下是否能用：打开python ,输入import numpy，若如下图所示，就说明安装成功！！！

 成功安装numpy之后，torch_geometric应该也可以了，毕竟刚刚就是numpy出现了问题才导致它不能执行。输入import torch_geometric，若如下所示，则表示安装成功！！！

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总结： 

 费了好久的时间才安装好，希望我的经验对大家有帮助！！！（也希望我的项目能成功运行！）