ubuntu安装R及R包

一、确定ubuntu版本

cat /proc/version

二、安装dirmngr以及添加安全密钥

#需要进入管理员账号

sudo apt install --no-install-recommends software-properties-common dirmngr
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

更新安装源

vim /etc/apt/sources.list

在文件最后添加

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/

#bionic对应的就是ubuntu的版本，我的版本是18.04

退出并更新

sudo apt-get update

三、安装R

sudo apt-get install r-base
sudo apt-get install r-base-dev

R安装BiocManager

#先选择镜像，选择清华的镜像安装

options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
install.packages("BiocManager")

下载安装R包

BiocManager::install(‘edgeR’)

查看R包是否已下载

library(edgeR)