数据源
cell
细胞系数据一共有四个矩阵数据,分别是,基因表达,体细胞突变,拷贝数变异三种类型,比如说,基因表达是该种细胞系与700个癌症基因在基因表达上的关系,其余类似。
记下来对每个细胞系矩阵数据通过切比雪夫进行相似度处理,分别得到四个580*580的数据。
drug data
药物数据一共有六种指纹图谱,五种药物与生物体的关系,一种药物与细胞系的关系
对12种药物矩阵数据进行相似度处理
fusion vector
对12个药物矩阵进行混合处理
model step
设计了一个交互模块,包括外积和内积单元,以捕获di和cj之间的细粒度和粗粒度交互。在外积单元中,首先在变换后的di向量和变换后的cj向量之间进行外积运算。可以得到48个(12×4)不同的外部相互作用图来表示di-cj。然后利用CNN网络从多个外部交互图中学习外部交互嵌入。CNN网络由两个残差块和一个CNN层组成,可以有效地利用di和cj交互的局部特征。最后,使用最大池化层从提取的交互嵌入中捕获全局信息。在内积单元中,首先进行内积运算,然后利用MLPInner模块(全连接层)学习嵌入。