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原创 医学统计学(郭秀花|第三版)前5章考试概念汇总

H0和H1是相互联系、对立的假设;样本均数的标准差称为标准误(standard error of mean,SEM),它反映样本均数间的离散程度,也反映样本均数与总体均数间的差异,因而说明了均数抽样误差的大小。:按照预先给定的概率(1-α)估计总体参数所在的范围,该范围称为置信区间或可信区间(confidence interval,CI),(1-α)称为置信度或可信度。1.异体配对:为消除混杂因素的影响,将某些重要特征相似的每两个受试对象配成一对,将每对受试对象进行随机分配后,分别给予两种不同的处理。

2023-12-23 21:35:01 848

原创 【20231220】

1.目前生物信息学--计算生物学方向硕士研究生研一新生一枚。Python和R会用,但不够深入。生物背景也差点意思。理好学习路线,别太懒。3.目前研一发现自己的学习好水啊。2.周围的人都好卷啊,只有我是小透明。更新学习进度---------期末考完。挖坑,大概率填(只会纯生信)

2023-12-20 21:34:33 343

原创 医学统计学(郭秀花)

置信水平95%概率的意思是指我们用某种方法构造的所有置信区间中有95%的区间包含参数的真值,而我们根据一个具体的样本所获得的某个特定的置信区间就是这所有区间中的一个,置信区间是一个随机区间,样本不同,置信区间也不同,并不是所有置信区间都包含真值!然而我们并不能认为99%的置信区间由于95%的置信区间,这是因为区间的精度(偏差)和区间的。(1)99%的置信区间有更高的可信度,其包含真值的可信度更高,但其区间宽度大,不精确。三聚氰胺的含量不应超过某个固定值,因此为该指标的总体均数95%的置信区间应为单侧。

2023-12-20 21:26:11 832

原创 医学统计学(郭秀花第三版)

变异系数(Coefficient of Variation):当需要比较两组数据离散程度大小的时候,如果两组数据的测量尺度相差太大,或者数据量纲的不同,直接使用标准差来进行比较不合适,此时就应当消除测量尺度和量纲的影响,而变异系数可以做到这一点,它是原始数据标准差与原始数据平均数的比。表达式是平均数的概念,它能够对总体的某一特征具有代表性,表明所研究的舆论现象在一定时间、空间条件下的共同性质和一般水平。(2)均数为4.7246;揭示资料的分布类型、观察资料的集中趋势和离散趋势、便于发现某些特大或特小的。

2023-12-20 21:24:51 396

原创 【无标题】

2022-05-23 10:48:49 84

原创 CIBERSORTx教程

CIBERSORTx是著名的去卷积工具。相比于CIBERSORT更优化了一些。第一步:注册自己的账号,想要免费则需要有个教育邮箱。商用的必然不是免费。第二步:CIBERSORTx需要三个非常关键的文件单细胞参考矩阵,标签矩阵和混池矩阵。其格式均有一定的要求。可以使用网站自己的示例文件练手,然后用自己的文件。第三步:针对自己的实验目的,看过程是否需要做批次校正等相关步骤。第四步:可以在Job results界面查看自己的实验结果。(CIBERSORTx也可以用R语言实现,具体看自己的功

2022-03-11 15:49:45 4763

原创 我,无任何编程知识,R笔记(不要嘲笑)

#fread函数用于二进制文件的输入和输出#limma程序包用于差异分析,RNS-seq voom方法既含有cDNA芯片的RAW data输入、前处理(归一化)功能,同时也有差异化基因分析的“线性”算法(limma: Linear Models for Microarray Data),特别是对于“多因素实验(multifactor designed experiment)”。limmar包的可扩展性非常强,单通道(one channel)或者双通道(tow channel)数据都可以分析差异.

2021-06-03 20:49:39 123

原创 Python常用单词书

Python常用单词书Dictionary 字典Float 浮点型List 列表Integer 整数类型Boolean 布尔String 字符串Set 无需不重复元素集Tuple 元组Function 函数Module 模块Object 对象Syntax 语法Value 值Variable 变量Indentation 缩进Generator 生成器Iterator 迭代器Method 方法Del 删除Import...

2021-06-01 19:04:57 253

原创 2021-05-30

Step1: 数据获取在NCBI的主页,Gene搜索框内输入SARS。并在其结果内下载蛋白质的fasta 格式的序列。Step2: 进入NCBI的BLAST界面在本实验中我们是蛋白质序列,所以点击Protein BLAST.输入序列后调参完毕,BLAST的界面数据获取。Step3:序列比对把文档导入MEGA 界面(方法自定),删除最后一行Sequence,因为是空行,然后全选Ctral+A,点击Muscle(肌肉图标),点击Align Protein,直接点击OK (Muscle 适合多

2021-05-30 09:17:04 2380

空空如也

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