#fread函数用于二进制文件的输入和输出
#limma程序包用于差异分析,RNS-seq voom方法
既含有cDNA芯片的RAW data输入、前处理(归一化)功能,同时也有差异化基因分析的“线性”算法(limma: Linear Models for Microarray Data),
特别是对于“多因素实验(multifactor designed experiment)”。limmar包的可扩展性非常强,单通道(one channel)或者双通道(tow channel)数据都可以分析差异基因,
甚至也包括了定量PCR和RNA-seq(第一次见分析microarray的包也能处理RNA-seq)。
R.utils程序包是解压gz,.bz2文件可以用到的
sep=""用于分隔xxx
sort(a$MBase /decreasing =T) 排序从小到大 [1]则取到第一个数,即最小值/最大值
table()函数用于观察数值量的多少,频数统计
fivenum(a$x)#中位数
mean(as.numeric(b[1,]))#单独一行的平均值
head(rowMeans(b))#整体行取平均值
#循环函数
apply(b,1,max)#取每一行的最大值
rowMax=function(x){apply(x,1,max)}#定义函数
paste("a1",1:20,sep="_")
#热图需要有行名
#怎么修改rstudio程序包的路径,不在C盘内