CIBERSORTx是著名的去卷积工具。相比于CIBERSORT更优化了一些。
第一步:注册自己的账号,想要免费则需要有个教育邮箱。商用的必然不是免费。
第二步:CIBERSORTx需要三个非常关键的文件
单细胞参考矩阵,标签矩阵和混池矩阵。其格式均有一定的要求。可以使用网站自己的示例文件练手,然后用自己的文件。
第三步:针对自己的实验目的,看过程是否需要做批次校正等相关步骤。
第四步:可以在Job results界面查看自己的实验结果。
(CIBERSORTx也可以用R语言实现,具体看自己的功底或者参考相关教程)