Linux + MacOS 下的 ORCA 安装与配置方法

前言

最近需要用 ORCA 算点东西，老板在服务器上很大方地给了 50 G 空间，目前够用，因此先在服务器上装一个。如果后面服务器上个人主目录空间不够了，再考虑在本地装一个。因此本文先对 Linux 版的安装做一个记录。

ORCA 安装与配置

参考 量子化学程序ORCA的安装方法 即可顺利完成 Linux 下的 ORCA 安装方法，本文参考的就是这篇博客。

进入 ORCA 官网，在 Donloads 中下载程序包，这里选择的是 ORCA 5.0.4, Linux, x86-64 shared-version, .tar.xz Archive，选择动态库版本 (shared-version) 是因为占用空间小，而且计算速度和静态库版没有太大差异。

本文末尾是我分享的 ORCA 包、手册以及对应版本的 OpenMPI。

OpenMPI 的安装

ORCA 在 Linux 下是借助 OpenMPI 实现并行，并行方式运行 ORCA 之前需要先编译 OpenMPI 库。官网上下载的 ORCA 程序包的名字中包含了所需 OpenMPI 库的版本，比如我的是 orca_5_0_4_linux_x86-64_shared_openmpi411.tar.xz，说明需要 OpenMPI 4.1.1。可在 OpenMPI 网站上下载各版本的 OpenMPI。

编译器的安装

ORCA 还需要 C++ 和 Fortran 编译器，如对于 CentOS，使用 yum install gcc和 yum install gcc-gfortran即可安装 gcc 和 gfortran 编译器。

如果像我一样使用的是服务器，可以先检查一下后台是否已为所有用户预装了 OpenMPI 以及所需编译器。若使用命令 mpiexec -V可以显示出 OpenMPI 版本，说明已经安装好了。

ORCA 本体的安装

解压压缩包，如下载的是 .tar.xz格式的包，使用如下命令解压：

tar -xf orca_5_0_4_linux_x86-64_shared_openmpi411.tar.xz

如解压后的目录为 /work/home/wsmrt33/orca504/，使用 vi ~/.bashrc打开 .bashrc，将下面内容加进 .bashrc的结尾：

export PATH=$PATH:/work/home/wsmrt33/orca504/
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/work/home/wsmrt33/orca504/

由于并行运行 ORCA 时必须写明绝对路径，因此在 ~/.bashrc中再加一行：

alias orca='/work/home/wsmrt33/orca504/orca'

使用 source .bashrc使上面的命令生效后可使用 orca代替命令 /work/home/wsmrt33/orca504/orca。

使用包含如下内容的 ORCA 输入文件 test.inp测试：

! B3LYP def2-SVP

* xyz 0 1
O    0.000000   0.000000   0.000000
H    0.757160   0.586260   0.000000
H   -0.757160   0.586260   0.000000
*

输入命令 orca test.inp，正常运行则说明安装配置成功。

后记

前一节的内容还没写完就发现个人目录已经挤爆了，原来是几个 Gaussian 任务中间文件太大占满了。看来存储空间还是不太够，因此还是老老实实在本地装个 ORCA 。

Windows 版的安装非常简单，可以参考这个视频。

MacOS 下的 ORCA 安装与配置

一步步按照 Orca Input Library 中给出的指导即可完成 ORCA 的安装，实在懒得翻的话，也可以参考我这篇。

ORCA 的 MacOS 安装非常简单，首先将从官网下载的压缩包解压，将解压出的整个文件夹重命名为 orca504放在 /Applications目录下。

对于 Mac OS 10.15 以及更新的版本：打开 Terminal 并进入 /Applications/Utilities目录，然后将如下指令复制粘贴到 Terminal 中：

echo 'export PATH="/Applications/orca504:$PATH"; export LD_LIBRARY_PATH="/Applications/orca504:$LD_LIBRARY_PATH"'  >> ~/.zshrc; source ~/.zshrc

对于旧一点的 Mac OS 版本则改为：

echo 'export PATH="/Applications/orca504:$PATH"; export LD_LIBRARY_PATH="/Applications/orca504:$LD_LIBRARY_PATH"'  >> ~/.bash_profile; source ~/.bash_profile

按下回车即可在任意位置使用 orca 命令。还是使用前一节中的例子，输入命令 orca test.inp，正常运行则说明安装配置成功。

然而，我这里弹出了这样的警告：无法打开“orca”，因为无法验证开发者。

打开系统设置中的隐私与安全性设置后，翻到最下面找到阻止使用 orca 的提示信息后点仍然允许。这样 orca 倒是可以正常运行了，但系统会针对计算任务中涉及的所有子程序一一弹出这个警告，挨个点允许非常麻烦，解决方法：进入 cd /Applications/orca后输入如下命令：

xattr -d com.apple.quarantine *

问题解决，计算任务正常结束：

TOTAL RUN TIME: 0 days 0 hours 0 minutes 1 seconds 994 msec

ORCA程序包 + 手册 + OpenMPI 提取码: orca