scanpy
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生信小博士
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python小白入门单细胞分析scanpy
Scanpy 和 Seurat 基本上完全一样,Scanpy 构建的对象叫做 AnnData 对象,他的数据存储是以4 个模块存储原创 2023-12-06 10:55:36 · 2400 阅读 · 0 评论 -
linux中python安装scanpy安装进行单细胞分析scrnaseq
4.此时import scanpy就运行成功了。原创 2022-12-23 19:08:09 · 1712 阅读 · 0 评论 -
使用wget批量下载geo数据集的全部文件 linux下载geo数据 geo处理的数据不是下载原始数据 Linux如何下载ftp文件 geo ftp geo ftp下载 geo下载
发现其文件有点多,而且一个文件 就67G了,在自己的电脑里面操作的可能性很小,所以就直接去服务器处理吧。当然了,后续的分析才是苦难的开始,虽然咱有普通atac-seq技术打底,学一个新技术会很快,但该有的挫折感并不会少!wget: unable to resolve host address 无法解析主机host地址解决办法。感兴趣的小伙伴也可以跟我一样,批量下载它们的结果,然后开启下游分析哦!一个很简单的shell脚本,就可以得到全部文件如下所示;发布于 2021-09-30 23:21。原创 2023-01-02 16:09:31 · 1158 阅读 · 0 评论