nii转png

使用nibabel的load函数来读取NIfTI文件。

python复制代码

	import nibabel as nib
	nii_file = 'path/to/your/image.nii' # 替换为你的NIfTI文件路径
	img = nib.load(nii_file)
	img_fdata = img.get_fdata() # 获取图像数据

3. 转换并保存为PNG图像

这里有两种主要的方法可以将NIfTI文件的切片保存为PNG图像：

方法一：使用imageio库（适用于每个切片）

python复制代码

	import imageio
	import os
	# 设定保存PNG的路径
	save_dir = 'path/to/save/pngs'
	if not os.path.exists(save_dir):
	os.makedirs(save_dir)
	# 获取数据的维度
	(x, y, z) = img_fdata.shape
	# 遍历Z轴上的每个切片
	for slice_index in range(z):
	slice_data = img_fdata[:, :, slice_index] # 获取切片数据
	# 保存切片为PNG文件
	imageio.imwrite(os.path.join(save_dir, f'slice_{slice_index}.png'), slice_data)

方法二：使用matplotlib库（适用于可视化并保存）

如果你想在保存之前查看切片，或者想要更复杂的图像处理（如色彩映射、缩放等），可以使用matplotlib。

python复制代码

	import matplotlib.pyplot as plt
	# 选择一个切片进行可视化
	slice_index = 0
	slice_data = img_fdata[:, :, slice_index]
	# 可视化切片
	plt.imshow(slice_data, cmap='gray') # 假设是灰度图像
	plt.axis('off') # 关闭坐标轴
	# 保存为PNG文件
	plt.savefig(os.path.join(save_dir, f'slice_{slice_index}.png'), bbox_inches='tight', pad_inches=0)
	plt.close() # 关闭图像以准备下一个