R语言绘制累计积分密度图（笔记）

最新推荐文章于 2023-05-02 10:25:39 发布

�路颜可��

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文章标签： r语言 excel 开发语言

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_55905518/article/details/129867018

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该代码段使用R语言的readxl库读取Excel数据，然后利用ggplot2库创建累积积分密度图，分别展示了Mapped和UnmappedReads的分布情况，通过stat_ecdf函数绘制了累积分布函数图，并对坐标轴、颜色、图例等进行了详细定制。

摘要由CSDN通过智能技术生成

绘制累积积分密度图code

######
######数据sum1_excel.xls
install.packages("readxl")
library(readxl)
sum_excel_data<-read_excel("路径.xls",col_names=TRUE)

temp_df<-as.data.frame(sum_excel_data)
temp_mt<-as.matrix(sum_excel_data)
sum_excel_data
xxx_data<-temp_df[,c(8,9,28,29)]
colnames(xxx_data)<-c("mapped reads number","mapped reads rate","unmapped reads number","unmapped reads rate")
ggplot(xxx_data, aes(x = xxx_data[,4])) + geom_density(colour = "cadetblue3")
group_mapped<-rep(c("Mapped"),185)
xxx_combine_mapped<-group_mapped
xxx_combine_mapped<-cbind(xxx_combine_mapped,temp_df[,c(8,9)])
group_unmapped<-rep(c("Unmapped"),185)
xxx_combine_unmapped<-group_unmapped
xxx_combine_unmapped<-cbind(group_unmapped,temp_df[,c(28,29)])
xxx_temp<-xxx_combine_