R_ggplot2基础（二）

作者：李誉辉  

四川大学在读研究生 

往期连载： R_ggplot2基础（一）

5 stat_xxx()统计变换

相比几何对象，增加了：

统计变换函数	描述	其它
stat_bin	直方图	分割数据，然后绘制直方图
stat_function	函数曲线	增加函数曲线图
stat_qq	Q-Q图
stat_smooth	平滑曲线
stat_ellipse	椭圆	常用于椭圆形置信区间，带状置信区间用geom_ribbon
stat_spoke		绘制有方向的数据点
stat_sum		绘制不重复的取值之和
stat_summary	分组汇总	可以求每组的均值，中位数等
stat_unique		绘制不同的数据，去掉重复值
stat_ecdf	经验累计密度图
stat_xsline	样条曲线拟合	见基础运算_3

查询其它的统计变换函数：
ggplot2 parts of the tidyverse
使用ls(pattern = '^stat_', env = as.environment('package:ggplot2'))

library(ggplot2)
ls(pattern = "^stat_", env = as.environment("package:ggplot2"))

重要例子：

5.1 stat_summary

要求数据源的y能够被分组，每组不止一个元素, 或增加一个分组映射，即aes(x= , y = , group =  )

stat_summary (mapping = NULL, data = NULL, geom = "pointrange", position = "identity", 
    ..., fun.data = NULL, fun.y = NULL, fun.ymax = NULL, fun.ymin = NULL, 
    fun.args = list(), na.rm = FALSE, show.legend = NA, inherit.aes = TRUE) 

参数解释：
* fun.data 表示指定完整的汇总函数，输入数字向量，输出数据框，常见4种:smean.cl.boot,smean.cl.normal,smean.sdl,smedian.hilow。 更多
* fun.y 表示指定对y的汇总函数，同样是输入数字向量，返回单个数字，这里的y通常会被分组，汇总后是每组返回1个数字
* fun.ymin 表示取y的最小值，输入数字向量，每组返回1个数字
* fun.ymax 表示取y的最大值，输入数字向量，每组返回1个数字

library(ggplot2)
library(Hmisc)

g <- ggplot(mtcars, aes(cyl, mpg)) + geom_point()
g + stat_summary(fun.data = "mean_cl_boot", color = "red", size = 2)  # 用mean_cl_bool对mpg进行运算，返回均值，最大值，最小值3个向量组成的矩阵

g + stat_summary(fun.y = "median", color = "red", size = 2, geom = "point")  # 计算各组中位数
g + stat_summary(fun.y = "mean", color = "red", size = 2, geom = "point")  # 计算各组均值
g + aes(color = factor(vs)) + stat_summary(fun.y = mean, geom = "line")  # 增加1组颜色变量映射，然后求均值并连线  
g +