R语言画箱线图

library(tidyverse)
library(patchwork)
install.packages("tidyverse")
install.packages("patchwork")

install.packages("reshape2")
install.packages("ggsignif")
.libPaths()

getwd()
setwd("F:/000/PLC_expression/boxplot/boxdata")
dat01<-read_delim("age.txt",delim = "\t")
dat01

# 加载R包,没有安装请先安装  install.packages("包名") 
library(ggplot2)
library(reshape2)
library(ggsignif)
# 读取ROC数据文件
#df = read.delim("https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/BoxPlot/boxplot.txt",# 这里读取了网络上的demo数据,将此处换成你自己电脑里的文件
#                header = T    # 指定第一行是列名
)
# 把数据转换成ggplot常用的类型(长数据)
df = melt(dat01)

# 绘图
ggplot(df,aes(x=variable,y=value,fill=variable))+
  geom_boxplot(alpha = 1,              # 透明度
               outlier.color = "black" # 外点颜色
  )+
  theme_bw()+                          # 白色主题
  theme(
    axis.text.x = element_text(angle = 90,
                               vjust = 0.5
    )       # x轴刻度改为倾斜90度,防止名称重叠
  )+
  geom_signif(                         # 添加显著性标签
    comparisons=list(c("T1st-La","T3rd-La"),c("T1st-La","T5th-La"),c("T1st-La","Egg"),c("T1st-La","Pupa"),c("T1st-La","Adult")), # 选择你想在哪2组上添加标签
    step_increase = 0.1,
    test="t.test",                     # "t 检验,比较两组(参数)" = "t.test","Wilcoxon 符号秩检验,比较两组(非参数)" = "wilcox.test"
    map_signif_level=                 # 标签样式F为数字,T为*号
  )
 

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