- 博客(11)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 Deepmd+DP-GEN(深度学习+主动学习)
大概流程就是利用初始数据训练出四个势函数，用其中一个势函数跑lammps 计算体系原子受力，并用其他三个势函数的预测结果对比，体系原子的最大受力超过fmax 则认为是糟糕构型（舍去），小于fmin则认为势函数预测准确，在fmin和fmax之间则为候补构型，将候补构型挑选一定数量进行下一步vasp单点能计算，完成后。然而它存在一定的问题，问题在于，训练的数据来自于数千步的AIMD过程，各个步数之间有着强烈的相关性，且结构相差不大，这对于探索相空间而言，略有瑕疵。欢迎关注公众号：硕博科研小助手，一起交流学习。
2024-03-04 15:34:16
1233
1
原创 LAMMPS+Phonopy计算声子色散曲线
机器学习训练完势函数之后，需要对加以验证。对于晶体而言，色散曲线是其衡量计算是否准确的最重要标准，当然，还有能量，比热，RDF等性质。
2024-01-14 15:37:17
1423
1
原创 Deepmd-kit 机器学习训练步骤
数据集的量有500-2000不等，当然数据集越多训练的越好。除此之外还有体系的原子数，同样原子数越多训练的越好。本文中通过VASP进行MD动力学过程，运行1000步，随机抽取200个数据集作为测试集，800个数据集作为训练集。02.lmp.将vasp运行的OUTCAR复制到00.data中，运行如下python代码进行数据集的划分。a:VASP运行需要4个文件：POSCAR，POTCAR，KPOINTS，INCAR。大概流程就这么多，有不清楚的地方，欢迎关注公众号：硕博科研小助手，联系我。
2023-09-23 12:08:52
1168
1
原创 DeepMD-kit Ubuntu 安装
DeePMD-kit是一种基于机器学习的分子动力学模拟方法，该方法是通过使用从头计算得到的数据对深度神经网络模型进行训练，从而得到通用的多体势能模型（DP模型）。最近自己也在学习这个，安装上遇到了一些问题，避免大家踩坑，下面给出相关建议。本例安装的是tensorflow_cpu==2.5.0 和python 3.8。3.安装deepmd-kit，这里安装离线版集成好了的deepmd-kit。终端输入：dp --h . 出现 usage的相关命令，则安装成功。欢迎关注公众号------硕博科研小助手。
2023-09-16 15:39:23
661
1
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人