4.1 脑影像数据储存格式

节选自http://blog.sina.com.cn/s/blog_4d25466d0101nppl.html

DICOM 源自： involving the American College of Radiologists(ACR) and the National Electronics
 Manufacturers Association (NEMA)，是存储Image最简单格式，它是用于不同类型数据交流的一个协议。即不同类型的图像用DICOM存后，便于同行业进行分析。
它存每个slice看到单独的file,这些files用它代表的slice number来命名。头文件信息也嵌在该文件里，必须解压缩方能读取。在所有的图像格式中，DICOM数据在头文件里header里保持元数据（元数据meta-data包括原始数据和图像的基本信息如：维度和数据种类等信息。）。由于其存的文件多，操作就麻烦了，为此数据分析前需要将DICOM数据进行转换。

NIfTI  National Institute of Mental Health and the National Institute of Neurological Disorders and Stroke 2000年开发的。2004年新版的NIfTI-1是Analyze7.5格式的拓展版，含有更多metadata.最重要的特点就是：它代表了在MRIscanner中的voxel indices 和spacial location的关系。使用合理的话，它会告诉我们哪边代表左脑。它标准的NIFTI文件拓展名.nii，里面含有header&image数据。

坐标系统

 

节选自https://www.cnblogs.com/haore147/p/3631448.html

dicom主要由扫描器产生，一般是一个slice一个文件；analyze 格式= .img/.hdr spm下用的最多；nifti ，由fsl & afni & spm几个老大哥共同确定的格式，支持3d或者4d。

一般从sanner拷出来的文件夹中，每一个文件夹里的dicom文件，代表一个被试一次run的结果。spm会自动将dicom转成hdr/img格式。