[20230606]Atomsk学习-cut命令

[20230606]-Atomsk笔记-cut命令：剪掉系统中一部分

1.语法

-cut [above|below] [d] [normal]

2.描述

这个选项可以“cut”一个系统，即去除掉给定平面的上部分原子或下部分原子。

3.参数解释

1. above|below：
   指定删除的原子是给定平面的上部分还是下部分。
2. d:
   给定平面到坐标轴原点的距离（Å）。
   所给的位置一般是Å单位，也可以通过按照盒子的大小来给定位置。
3. normal:
   剪切面的垂直方向，可以是x，y，z或是一个晶体学方向（见下）。
   可以是‘x’，‘y’，‘z’（相对于笛卡尔坐标轴），或者是系统中定义好的晶体学方向（如通过选项-properties来定义）。然后考虑Miller指数与该方向的关系。否则方向假定为X=[100]，Y=[010]，Z=[001]。
   如果有的原子有shells（就一个离子的核壳模型而言），就是相对于核的位置而言。当一个原子被删除了，则它的核和壳都会被删除。

4.注意

这个选项没有改变超胞的参数，换句话说，它在所删除原子位置制造了一个空位区域。

5.缺省

缺省下系统没有被切除。