膜蛋白模拟
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rogerzhanglijie
这个作者很懒,什么都没留下…
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构建磷脂双分子层(一)
今天心情糟透了,找了很长时间关于建磷脂双分子层的资料。愣是么没到几篇,最后没办发了,研究院的网速慢的跟牛车似的。TNND,受不了了,自己找英文资料看吧。 Charmm-GUI 提供了构建膜的相对简单的方法:下面我将看的英文手册自己总结一下: Charmm-GUI中提供了一个Membrane Builder模块,用于构建膜双层结构.在构建膜蛋白的过程中与许多的方法,Charm原创 2013-01-08 16:24:42 · 18806 阅读 · 1 评论 -
构建磷脂双份子层(二)
前面的内容由于空间不够了,呵呵,现在只能再换一页,接着上面的写:5:建立系统的成分:这个过程与只有膜结构的系统成分的建立过程类似。因为这个过程中我们产生了孔洞水,页面会提示你优化孔洞水分子,对于那些没有在孔洞中的水分子要删除(用蛋白软件将产生的PDB文件打开,观察体系中是否与暴露在孔洞外面的水分子,如果存在的话将那些水分子移除。6: 先建立磷脂双分子层,然后产生离子和水分子原创 2013-01-09 11:00:07 · 3720 阅读 · 0 评论