生物信息
文章平均质量分 53
rogerzhanglijie
这个作者很懒,什么都没留下…
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肿瘤早筛有望实现新的突破
肿瘤的发生与人类基因组的变化有密不可分的关系,其实,微生物和病毒的也和癌症发生有着千丝万缕的联系,例如胃癌的发生和EBV病毒感染直接存在关联关系,HPV感染也可能导致宫颈癌的发生。2020年3月11日,Nature期刊发表了一篇基于微生物与肿瘤发生的文章,美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校的科研人员,整理了TCGA(癌症基因组数据库)33种癌症中的18116个样本的全基因组和全转录组的数据,利用...原创 2020-03-15 22:24:06 · 552 阅读 · 0 评论 -
16s_rRNA分析软件
QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology)是一个专门针对于微生物群落的分析管道,可以进行OTU,以及多样性分析,等等。拥有处理16s rRNA所需要的软件并呈现相应的处理结果。所谓分析管道必是集成软件,QIIME也不例外。因此安装起来比较麻烦。而且根据网站(http://qiime.org/)上给出主流的安装说明,需要将分析软件一个一个转载 2015-04-29 08:58:57 · 2727 阅读 · 0 评论 -
Pymol高级作图技巧汇总
Pymol高级作图技巧汇总一、设置背景为透明在Pymol主菜单中选择setting->Edit All...,然后从搜索框中查找opaque_background, 将其设置为off原创 2017-03-25 11:30:22 · 26595 阅读 · 0 评论 -
常用生物信息学格式介绍
前言fastafastqgff2gtf(gff2.5)gff3bedsam、bam vcf前言在各个行业都是有行业标准的,这样才能统一规范而方便后面的分析,在生物信息学领域中主要是各种大量序列数据、注释数据等,这些都是有特定的格式去表示,下面列举几种常见的格式。了解这些是进行后续生物信息学分析的必备知识转载 2017-08-01 10:17:54 · 2105 阅读 · 0 评论