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猿大人007
这个作者很懒,什么都没留下…
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picrust 功能预测应用
## 0 16s 分析可以得到菌群组成,该怎么把物种和它的“功能”对应起来呢?picrust 功能预测工具应运而生## 1 应用于16s rRNA 序列预测功能分析(KEGG、COG)## 2 分类的参考数据库必须是Greengene## 3 原理和深入解读参考:16S扩增子测序与PICRUSt分析,将成为研究新趋势根据16S预测微生...原创 2018-09-04 14:02:14 · 6235 阅读 · 0 评论 -
功能分析之KEGG
基因功能分析,是指利用生物信息学和不同表达系统对基因的功能进行的预测、鉴定和验证。KEGG是一个整合了基因组信息、化学信息和系统功能信息的数据库。功能信息存储在PATHWAY数据库里,包括图解的细胞生化过程,如代谢、膜转运、信号传递、细胞周期,以及同系保守的子通路信息;一,如果从功能出发,可以由功能到通路再到基因,迅速锁定某一功能的关键基因;二,从基因出发,可以获得某个基因在...原创 2018-09-03 13:56:04 · 10157 阅读 · 0 评论