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16s 分析可以得到菌群组成,该怎么把物种和它的“功能”对应起来呢?picrust 功能预测工具应运而生
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应用于16s rRNA 序列预测功能分析(KEGG、COG)
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分类的参考数据库必须是Greengene
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原理和深入解读参考:
PICRUSt的基本原理
PICRUSt的总体思路说来很简单,主要分为3步:
1. 先根据已测微生物基因组的16S rRNA基因全长序列,推断它们的共同祖先的基因功能谱;
2. 对Greengenes数据库中其它未测物种的基因功能谱进行推断,构建古菌和细菌域全谱系的基因功能预测谱