KOBAS 3.0学习

在线通路注释，一般使用DAVID、KASS、KOBAS等工具。

Kobas : KOBAS（基于KEGG Orthology Based Annotation System）是用于基因/蛋白质功能注释（注释模块）和功能集富集（Enrichment module）的Web服务器。给定一组基因或蛋白质，它可以确定通路，疾病和基因本体论（GO）术语是否显示统计学显着性。

KOBAS 3.0由两个功能组成，注释（Annotation）和富集（Enrichment）

KOBAS 3.0的输入不支持gene symbol，一般操作将Symbol ID转换成Entrez Gene ID（或者）ensembl格式的ID。

推荐进行基因ID转换的网站：gprofiler ： http://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gconvert.cgi

注释（Annotation）：

对于Annotation模块，它接受基因/蛋白质列表作为输入，包括ID或序列。 对于每个基因，您可以找到与该基因相关的途径，疾病和基因本体(GO).

富集（Enrichment）

富集模块为您提供答案,了解哪些途径,疾病和GO术语与您刚输入的基因/蛋白质具有统计学意义。

该模块在KOBAS 2.0中称为“识别”。它接受与Annotation模块相同的输入格式，并且还允许Annotation模块的结果作为输入（请参阅3.1中的详细信