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神经科学之路
文章平均质量分 92
道不可以打折扣
人可以受委屈
道不可以打折扣
对大脑很着迷
朝闻道夕死可矣
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大脑可视化:多种方式实现fMRI的ROI的绘图
本文详细介绍了如何使用BrainNetViewer这一专业软件来实现大脑区域兴趣(Region of Interest,简称ROI)的体积可视化。BrainNetViewer是一个功能强大的神经影像学工具,它能够帮助研究人员以三维的形式直观地展示大脑结构和功能区域。它主要在基于matlab的环境运行。目录前言操作步骤1.设置路径2.运行GUI3.载入文件。原创 2024-08-22 21:31:58 · 531 阅读 · 0 评论 -
基于spm实现计算脑簇(Cluster)和大尺度脑网络(Large-Scale Network)的重叠
在神经科学的处理中,经常会出现想通过大尺度脑网络的视角来分析某一脑区的情形,首先我们要判断簇(Cluster)属于哪个网络,其次我们想要得知量化的信息与某网络的重叠百分比。那拿到Cluster的掩模与脑功能网络的模版后,有哪些方法可以计算重叠比例呢?目录前言一、基于可视化软件进行简单查看一、基于matlab进行百分比量化的计算1.计算重叠比例2.画图。原创 2024-08-16 22:27:25 · 734 阅读 · 0 评论 -
神经成像元分析(meta-analysis)中基于种子点差异映射(SDM)算法的哲学与方法论
本文将介绍神经成像领域元分析的发展历程,探讨:SDM算法克服了哪些统计错误?比起其他的元分析方法,可以更多的回答哪些问题?其背后体现对脑功能本质理解的何种哲学? 然后介绍基于SDM软件包,进行resting-fMRI 元分析的步骤。原创 2024-07-30 16:13:48 · 1250 阅读 · 0 评论 -
基于DPABI进行独立样本t检验计算VBM的组间差异
本文介绍了从cat12工具包提取出灰质体积后,进行组间比较的原理与思路,详细介绍了独立样本t检验的统计模型,以基于DPABI统计分析的步骤。从而得到了疾病组比健康组灰质体积显著减少的脑区,将其提取为ROI-mask,后续将和临床指标计算相关。原创 2024-07-29 19:58:40 · 1068 阅读 · 0 评论 -
如何用掩模(mask)提取MRI图像的原理与技术
原始MRI图像。:灰质mask。提取出的MRI里的灰质图像。都是三维矩阵,且其三者的维度相等并等于对于图像中的每个体素,我们都可以用来表示其位置。笔者进行VBM(体素形态学)组间比较时发现不同组因T1图像不同,分割后的灰质图像维度并不一致,为了让每个体素单位的统计检验更可靠,学习将三组在同一空间再次应用灰质掩模后比较。图7 按本文步骤提取的灰质图像I%3AMG%3AI%2CM%2CG。原创 2024-07-28 17:16:59 · 869 阅读 · 0 评论 -
基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记(二)感兴趣区(ROI)&全脑体积(TIV)
本文介绍了用cat12运算VBM前,如何抓取ROI信息;运算VBM后,如何转化ROI文件和提取全脑体积,为之后的统计分析做好准备。t=N7T8基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记(一)VBMhttps://mp.csdn.net/mp_blog/creation/editor/140665644。原创 2024-07-26 14:56:17 · 845 阅读 · 0 评论 -
基于CAT的VBM和SBM计算学习笔记(一)VBM
回顾一下,本笔记介绍了从T1原始图像到灰质体素图像的全过程。在先使用DPABI软件预处理好T1图像后,用Cat的Segment自动化功能得到分割后的灰质体素图像,再用spm进行Smooth。那么就得到了可以使用的灰质体积图像,后续再通过TIV得到全脑体积,然后进行组间比较、临床相关等统计分析即可。原创 2024-07-24 18:47:30 · 1474 阅读 · 0 评论