基于U-Net的眼底图像血管分割实例

最新推荐文章于 2024-03-29 08:41:40 发布
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分类专栏： 图像分割 文章标签： 深度学习 图像处理 python
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/round_fox/article/details/111405663
版权
本文介绍了使用U-Net模型进行眼底图像血管分割的实例，包括数据处理和模型测试。参考了orobix/retina-unet的GitHub项目和相关博客，详细说明了安装依赖库、运行代码的步骤，以及如何生成测试结果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

基于U-Net的眼底图像血管分割实例

参考代码：https://github.com/orobix/retina-unet

参考博客：https://blog.csdn.net/u013063099/article/details/79981097

1. 装包，参考博客依赖的库，如果不清楚对应版本关系，最好同博客上的一致；

                         

2. 运行，参考github (https://github.com/orobix/retina-unet) 上的readme；

 

          1)  python prepare_datasets_DRIVE.py：

               处理数据，生成DRIVE_datasets_training_testing文件夹下的内容；

    2) python run_training.pyÿ

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【Pytorch项目实战】之语义分割：U-Net、UNet++、U2Net
shinuone的博客
02-11 6433
图像分割：对图像中属于特定类别的像素进行分类（逐像素分类）。 图像分类：识别图像中存在的内容。 目标检测：识别图像中的内容和位置（通过边界框）。 语义分割：识别图像中存在的内容以及位置（通过查找属于它的所有像素）。
“基于U2Net的眼底视盘分割--Pytorch”项目的环境配置
m0_69524113的博客
07-05 280
简述为“基于U2Net的眼底视盘分割–Pytorch”项目的环境配置。
u-net眼底图像血管分割keras，kaggle竞赛代码修改版
10-19
修改后，输入图像可以是任何大小要求jpg格式，如果不是要修改resize文件，需要基于keras（这个很好装的），图像放入指定文件，然后运行就可以了，输出在test里面，输出图像改为输出血管结果图像，且只能应用于测试，亲测对一般眼底图像数据库分割效果都很好。有问题或不能运行戳我。
U-net眼底血管分割实例运行记录
weixin_43484095的博客
09-05 590
安装环境：用anaconda prompt安装 直接一路pip install xx过去 CUDA 记住安装10.0 不是10.1 必须配置路径 CUDNN由于不可知力量，必须一个一个复制粘贴替换 第一步需要import os import h5py import numpy as np import PIL from PIL import Image 还得定义write_hdf5 def wri...
利用图像分割技术(U-Net)提取眼底图像当中的血管图像
luxinfeng的博客
03-07 6361
利用图像分割技术提取眼底图像当中的血管图像 前言 眼底图像的研究一直是计算机视觉在医学领域的热点。此次，我的研究中的一部分就涉及眼底血管的提取，因此，想写这篇博文作为自己的一个存档记录。 环境搭建 在此次眼底图像的分割中，我采用的U-Net神经网络来进行操作。U-Net网络源码已经被论文的作者放在GitHub上了。操作文档写的非常详细，但是在第三方依赖库方面，官方文档写的有点小问题。我把自己在实际...
毕业设计-基于机器视觉的眼底视网膜血管语义分割-U-net
Hai_Lang_IT的博客
04-03 1547
毕业设计-基于机器视觉的眼底视网膜血管语义分割-U-net：眼底血管与人体健康息息相关，同时也作为医生诊断各 类眼科疾病以及心脑血管疾病的重要依据。眼底视网膜血管 结构特征变化与高血压、动脉硬化等心脑血管疾病有着密切 的联系，医生借助计算机图像处理技术，可以自动获取到眼 底图像中的血管形态。眼底图像血管提取的传统方法有匹配 滤波方法、阈值分割方法、形态学处理方法等。这些方法不 需要训练模型，但是血管分割的精度不够高。基于机器学习 的方法利用人工标记的血管图像来训练模型，以实现血管的 提取，Staal利用KN
简明代码实现Unet眼底图像血管分割
啊哦的博客
10-14 6556
项目工程文件结构如下： 参考了Retina_Unet项目，决定自己用代码来实现一遍，数据增强不是像Retina_Unet那样随机裁剪，而是将20个训练数据集按顺序裁剪，每张裁剪成48x48大小的144个patch，20张一共裁剪出2880个patch。 Unet模型：模型输入的张量形状为（Npatch,1,48,48），输出为（Npatch,2304,2）。Npatch表示训练集的样本数，本例中...
论文阅读笔记-GT U-Net: A U-Net Like Group TransformerNetwork for Tooth Root Segmentation
XZH16047129的博客
12-27 2821
目录 摘要 1.引言 摘要 为了实现对根管治疗的准确评估，一个基本的步骤是对口腔x线图像进行牙根分割，因为牙根边界的位置是根管治疗评估中重要的解剖信息。然而，模糊边界使得牙根的分割非常具有挑战性。在本文中，我们提出了一种新的端到端U-Net like Group Transformer Network(GTU-Net)用于牙根的分割。该网络保留了U-Net的基本结构，但每个编码器和解码器都被一个组Transformer所取代，利用分组结构和bottleneck结构，大大降低了传统transform.
基于改进U-Net视网膜血管图像分割算法
01-26
针对视网膜图像中血管细小而导致其分割精度低等问题,通过在U-Net网络中引入Inception、空洞卷积与注意力机制等模块,提出一种改进U-Net视网膜血管图像的分割算法。首先,在编码阶段增加Inception模块,采用不同尺度的卷积核对图像进行特征提取,以获得其多尺度信息;然后,在U-Net网络的底部增加级联空洞卷积模块,以在不增加网络参数的情况下扩大卷积操作的感受野;最后,在解码阶段为反卷积操作设计了注意力机制,将注意力机制与跳跃连接方式相结合,聚焦目标特征,以解决权重分散等问题。基于标准图像集DRIVE的实验结果表明,所提算法的平均准确率、灵敏度与特异性较之U-Net算法分别提高1.15%,6.15%与0.67%,也优于其他传统分割算法。
基于计算机视觉实现视网膜图像中的血管分割附matlab代码.zip
05-26
1.版本：matlab2019a，不会运行可私信 2.领域：【图像分割】 3.内容：基于计算机视觉实现视网膜图像中的血管分割附matlab代码.zip 4.适合人群：本科，硕士等教研学习使用
matlab除噪声代码-VesselExtract:基于U-net的CNN，用于分割血管，然后从眼底图像中去除血管
05-26
matlab除噪声代码船只提取 基于CNN的系统，用于对血管进行分割，然后从眼底图像中去除血管，以使用在此清理过的眼底版本上方训练的分类器以及经过训练的分析器来分析血管图以识别与血管形状相关的临床特征的分类器，从而提供更好的诊断模型，像船只的曲折。 训练数据 训练数据是从和数据集中获得的。 对于STARE数据集，使用由Valentina Kouznetsova注释的目标血管图，因为它更加详细。 数据预处理和数据集生成 笔记本用于根据DRIVE和STARE数据集中的可用图像生成256 X 256色块的庞大数据集。 补丁是随机生成的。 对于健壮的训练，还会生成涉及图像翻转和噪声添加的补丁。 为了使用笔记本而不进行任何更改，请确保以下树结构用于存储DRIVE和STARE数据集： VesselExtract/ ├── DRIVE │   ├── test │   └── training ├── STARE │   ├── labels-vk │   └── stare-images ├── generate_patches.ipynb ├── README.md ├── research_m
Python-使用UNet进行图像分割
08-10
使用U-Net进行图像分割
眼底血管分割 Matlab 程序.zip
05-22
项目流程主要分为两部分：预处理、分割提取。预处理的任务是滤除噪声、增强图像对比度及增强血管边缘，以便后续处理，包括：中值滤波、CLAHE、同态滤波。分割提取的任务是处理经过预处理的眼底图像，提取分割出血管，包括：Frangi滤波、阈值处理、形态学处理。
U-net学习笔记
qq_45813977的博客
07-19 7250
本文只是记录自己的学习过程，并不是面向技术向的硬核文章。U-net首见于这篇论文U-Net，距今7年，算是比较老的模型了，但是它的引用量突破了四万，由此看来，它的重要性不言而喻。U-net初始论文的标题就告诉我们，它是一个用于医学图像分割的卷积神经网络。...
【人工智能Ⅱ】实验4：Unet眼底血管图像分割
最新发布
m0_65787507的博客
03-29 2345
下采样可以增加对输入图像的一些小扰动的鲁棒性，比如图像平移，旋转等，减少过拟合的风险，降低运算量，增加感受野的大小。根据预测结果可以分析得到：在训练迭代次数较高的情况下，模型能够完全完成对眼球图像进行分割，所有眼球中的血管基本保持一个较高的能见度。根据预测结果可以分析得到：在训练迭代次数较低的情况下，模型并不能很好的对眼球图像进行分割，只能看到比较粗的血管的纹路。而后，模型采用Adam作为优化器，0.001作为初始学习率，交叉熵函数作为损失函数。在模型训练过程中，采用64作为批大小，100作为迭代次数。
基于U-Net模型的视网膜血管分割
学习日常分享
05-14 8085
(1) 视网膜血管图像数据集DRIVE简介 DRIVE (Digital Retinal Images for Vessel Extraction)数据集是用于视网膜病变研究的数据集，相关图像均来自于荷兰的糖尿病视网膜病变筛查计划，其被用于视网膜图像中的血管分割比较研究。该数据集由图像科学研究所于 2004 年发布。 DRIVE数据库已经建立，可以对视网膜图像中的血管分割进行比较研究。视网膜血管分割和描绘视网膜血管的形态属性，如长度、宽度、弯曲度、分支模式和角度，用于诊断、筛查、治疗和评估各种心血管和眼科疾
零基础基于U-Net网络实战眼底图像血管提取
李响
03-22 4778
文章目录1 前言2 血管提取任务概述3 U-Net架构简介4 眼底图像血管分割代码5 结果评估可视化(ROC曲线)6 改进U-Net网络完成眼底图像血管提取任务思路 1 前言 本文基于U-Net架构完成了视网膜血管的提取任务，基于Keras框架更简单的实现分割，网络、工具类、训练和预测的代码一目了然
深度学习图像分割：U-net与Focal Loss详解
- U-net是一种经典的图像分割网络，基于编码-解码结构，尤其适用于医学图像处理，后来也被广泛应用于其他领域。 - U-net++改进了特征融合，引入了特征拼接和更全面的特征融合策略，类似于DenseNet的思想，利用所有...
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