Bogotá河微生物群落代谢网络重构

最新推荐文章于 2022-06-22 07:00:25 发布
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分类专栏： 文献阅读 文章标签： 代谢网络重构
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本文链接：https://blog.csdn.net/ruby912/article/details/91381793
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通过对波哥大河流的微生物群落进行代谢网络重构分析，研究发现其在功能上与污染水域微生物群落相近。通过物种构成、拓扑学分析、功能注释等方法揭示了微生物群落的功能特性。尽管物种构成存在差异，但代谢网络的相似性表明河流可能受到污染。利用Flux balance analysis进一步探讨了代谢流特性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Metagenome level metabolic network reconstruction analysis reveals the microbiome in the Bogotá River is functionally close to the microbiome in produced water

Ecological Modelling 2019 2.5
Universidad de los Andes
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304380019300560?via%3Dihub

Points:
物种构成的差异并不等于功能的差异，为了了解波哥大河流的污染情况，作者重构了波哥大河流和网上下载的污染水域微生物群落的curated metagenome level network，发现波哥大河流微生物群落在功能上和污水微生物群落接近

在这里插入图片描述

物种构成

MG-RAST
堆积条形图
表格

代谢网络重构

gapfill 找到通路中存在

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