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原创 叶绿体基因组覆盖深度绘图

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2024-03-09 22:57:52 418

原创 叶绿体基因组共线性分析与四分体结构鉴定

我们首先应该确定参考序列的SSC方向是我们想要的方向,一般是ycf1长基因位于SSC末端的是NCBI中常见的序列。然后进行共线性分析,如果结果如图3,表现出良好的共线性时(即一条直线时,则表示SSC方向相同),如果如图4时,则表示SSC方向相反,因此需要进行SSC方向的调整。具体的脚本和使用方法,请看B站视频。共线性参考链接。

2023-10-22 17:37:56 465 1

原创 叶绿体基因组简单重复序列(SSRs)分析

叶绿体基因组简单重复序列(SSRs)分析

2022-12-05 22:34:45 4101 8

原创 叶绿体基因组核酸多态性(Pi)分析

叶绿体基因组Pi分析

2022-11-22 22:42:55 2352

原创 叶绿体基因组注释脚本思路

叶绿体基因组注释篇-注释脚本研发

2022-11-11 21:12:11 347

原创 叶绿体基因组注释PGA篇

叶绿体基因组PGA注释篇

2022-10-31 21:56:24 1696

原创 叶绿体基因组注释-Geseq篇

叶绿体基因组注释Geseq篇

2022-10-28 12:00:44 4843

原创 叶绿体基因组组装方法

叶绿体基因组组装

2022-10-24 13:15:15 2921

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