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原创 叶绿体基因组共线性分析与四分体结构鉴定
我们首先应该确定参考序列的SSC方向是我们想要的方向,一般是ycf1长基因位于SSC末端的是NCBI中常见的序列。然后进行共线性分析,如果结果如图3,表现出良好的共线性时(即一条直线时,则表示SSC方向相同),如果如图4时,则表示SSC方向相反,因此需要进行SSC方向的调整。具体的脚本和使用方法,请看B站视频。共线性参考链接。
2023-10-22 17:37:56 935 1
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