R按比例大小画2个以上的数据的Venn图

最新推荐文章于 2024-05-25 21:00:23 发布
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分类专栏： R语言
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vennDiagram虽然是我画Vene图首选，但是画两个以上就不会按数据比例画圆圈,而是一样大的圆。但是vennerable可以，唯一不足的是颜色不能设置

# BiocManager::install("RBGL","reshape")
install.packages("Vennerable", repos="http://R-Forge.R-project.org")
library(vennerable)
data<-Venn(list("186"=paper,"100"=my, "7"= vgene))    #使用Venn函数处理数据，完成了集合的命名并存入
data（变量名可以随便起）
plot(data,doWeight=T) # doWeight即按比例权重画圈

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sbt8814564153
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R- Vennerable绘制含有面积比例的Venn图
01-06 4697
Venn（维恩图）可以用来表示集合及其相互之间的关系。有时我们希望Venn能够将集合的大小用图形的面积表示出来，从而提供更丰富更直观的信息。 Vennerable能够在R中画出含有面积比例的Venn图，其它画Venn的包，似乎都没法实现这个功能。如果哪位大神有好的工具，求留言推荐。 1.安装 离线安装：下载页面 在线安装：R命令行中使用如下命令： install.packages
【R作图】按面积比例画韦恩图
qxx0828的博客
03-14 709
【代码】【R作图】按面积比例画韦恩图。
Cell同款 | 成比例韦恩图
最新发布
悟道西方
05-25 393
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R语言画韦恩图
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07-25 2万+
1.安装和导入的包   install.packages("VennDiagram") library(grid) library(futile.logger) library(VennDiagram) 2.两个数据集 可以根据数据量的大小来确定圆的大小 # A simple two-set diagram （根据数据量多少而确定圆的大小）前提是知道数据集的大小和交叉个数 venn...
跟着Cell学作图 | 12.韦恩图(Vennerable包)
weixin_45822007的博客
05-28 3244
“实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习生信的最好办法。”2021.4.12_1DOI: 10.1016/j.cell.2020.05.032这篇2020年发表在cell上关于新冠的组学...
利用R绘制venn图（VennDiagram、eulerr、venneuler、limma）
Kanny
01-18 6万+
最近对利用R绘制venn图进行了一些学习。参考了网上很多资料： 【R作图】在R中绘制韦恩图的几种方法 和 一些漂亮的venn图 如何使用R来绘制韦恩图（Venn Diagram） venn.diagram: Make a Venn Diagram 具体包括下面三个包： limma、venneuler、VennDiagram。总的来说，三个包都有着各自的不足。下面会一一进行说明，这里先放上结论：...
R语言绘制不一样的韦恩图
qq_42090739的博客
12-30 3212
image.png 韦恩图本来是不想说的，因为很简单，也有在线工具，然而还是有小伙伴询问如何制作韦恩图，那种韦恩图的元素大小用不同大小的圈表示，在线工具可以实现：http://www.biovenn.nl/index.php 图片 但是架不住很多人问R语言如何做，所以还是说一下韦恩图的R画法。同时，也将这个内容升级一下，平常我们见到的韦恩图最多也就是4个集合，但是当大于4的时候，韦恩图可以画出来，可是可视化的效果乱七八糟，导致结果没有任何意义。所以这里也提供一种不一样的集合元素的展示方法，本质..
解决RStudio中"plot.new() : figure margins too large"问题
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使用R进行VENN_维恩图或韦恩图_的绘制_2020-11-08
孤星夜神的博客
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## 1.导入R包 library("VennDiagram") library("rio") ## 2.设置当前工作目录 if (length(path) != 0) { setwd(path) } else { setwd("./") } ## 3.读取提前准备好的数据 venn_data_index <- list.files(path = "./", pattern = "^venn_data") venn_data <-...
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本资源"venn图_R语言绘制SCI图的输入文件及代码.rar"提供了使用R语言绘制Venn图的输入文件和代码示例，对于想要在科学出版物（SCI）中使用Venn图的学者来说非常有用。 首先，让我们详细了解一下如何在R中使用`...
R studio出现figure margins too large问题
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出现原因：RStudio里的【Plots】窗口太小，可以适当调大一点，或者把RStudio设置为全屏 解决方法来源：https://blog.csdn.net/sanqima/article/details/51339341
【R语言】——VennDiagram包绘制维恩图（保姆级教程）
weixin_54004950的博客
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维恩图（Venn diagram），也叫文氏图、温氏图、韦恩图、范氏图，用于显示元素集合重叠区域的关系型图表，通过图形与图形之间的层叠关系，来反应数据集之间的相交关系。当前R语言中的VennDiagram包可用于2元到5元的图维恩绘制，而大于5元的情况这需要借助R语言的另一个R包——关注公众号，发送“Venn”获得完整代码以及演示数据包。UpsetR包（下期将做展示）。好了本次分享就到这里。
在线作图|如何画韦恩图（包含upset图）
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韦恩图（包含upset图） 韦恩图（Venn diagram）用于展示在不同的事物群组（集合）之间的联系。R 语言中的维恩图绘制有很多包，Vennerable（最多9维），VennDigram（最多5维），venn（最多7维），而UpSetR绘制的维恩图则更多，只是表现形式和其他图不太一样。以upset图动态统计并展示集合间共有/特有元素信息。统计样品之间的共有、特有元素。应用范围：适用于微生物、转录组、代谢组、单细胞等组学。如分析组间共有、特有物种；分析各比较组显著差异的共有、特有pathway/基因等。
R语言制作5元以上Venn图
06-01
要制作5元以上的Venn图，可以使用R语言中的`venneuler`包和`ggplot2`包来实现。下面是一段代码示例： ```R # 安装和加载所需的包 install.packages("venneuler") install.packages("ggplot2") library(venneuler) library(ggplot2) # 构建数据框，每个元素为一个字符向量，表示一个集合 sets <- data.frame( Set1 = c("A", "B", "C", "D", "E", "F", "G", "H"), Set2 = c("A", "B", "C", "D", "I", "J", "K", "L"), Set3 = c("B", "C", "D", "E", "I", "J", "M", "N"), Set4 = c("A", "C", "E", "G", "I", "K", "M", "O"), Set5 = c("B", "D", "F", "H", "J", "L", "N", "O") ) # 使用venneuler包计算Venn图要素 venn <- venneuler(sets) # 使用ggplot2包绘制Venn图 ggplot(venn) + geom_circle(aes(x = 0, y = 0, r = radius, fill = id)) + coord_equal() + theme_void() + geom_text(aes(x = x, y = y, label = label), size = 4) ``` 这段代码会生成一个包含5个集合的Venn图，每个圆圈表示一个集合，重叠区域表示对应的交集。你可以将`sets`数据框替换为你自己的数据，以生成相应的Venn图。
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