49、深度学习与光学生物传感器：细菌基因转录及生物传感技术新进展

深度学习与光学生物传感器：细菌基因转录及生物传感技术新进展

在生物学和生物医学领域，对细菌基因转录的研究以及生物传感器的开发一直是重要的研究方向。本文将深入探讨细菌基因转录的深度学习方法，以及基于表面等离子体共振的光学生物传感器的发展。

细菌基因转录的深度学习方法

基因表达包含转录（DNA 到 RNA）和翻译（RNA 到蛋白质）两个连续步骤。转录过程是基因表达的关键，它通过寻找可访问的启动子并聚集蛋白质复合物来启动，这是开启和关闭基因以及识别细胞状态的基本步骤。

DNA 测序是将核苷酸按特定顺序排列在染色体上的技术，包含腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）和鸟嘌呤（G）四种碱基的顺序。通过生物信息学工具，如在 MATLAB 中实现的工具，可以提高碱基质量和比对准确性。生物信息学在 21 世纪的研究领域中是一个令人鼓舞的工具，它帮助我们理解生物学与生物数据计算之间的关系。

转录过程分为三个步骤：
1. 起始 ：RNA 聚合酶尝试寻找启动子，结合到 DNA 序列上，形成新的 RNA 序列。此时，DNA 双链模板被 RNA 聚合酶分离，形成新的单链模板。
2. 延伸 ：RNA 聚合酶以单链为模板，从 5′到 3′方向读取模板，逐个添加互补核苷酸，形成 RNA 单链。RNA 转录本中包含尿嘧啶（U）而非胸腺嘧啶（T）。
3. 终止 ：当遇到终止信号（如 UAA、UAG 和 UGA）时，RNA 转录本完成，从 RNA 聚合酶中释放，mRNA 被释放。

下面是转录过程的伪代码：