在使用Mega软件进行氨基酸序列对齐并保存为FASTA格式后，尝试在WebLogo3中分析，发现只能导出EPS和Data格式，且旧版WebLogo只能显示bits。对于复杂的蛋白质序列，需要WebLogo3的probability功能，但EPS无法打开，且缺乏R语言编程能力。寻求解决方案，尤其是简化代码的方法。
直说主题，用mega软件的Alignment功能导入了氨基酸肽段序列信息后，保存为FASTA格式。
截取了部分
导入WEBLOGO3页面，output选项当中，只有EPS和Data格式是可以点击的。
旧版本的weblogo，只可以画出bits的效果
想要达到下图的probability的话只能用weblogo3，虽然可以利用r语言跑代码绘画，奈何本人代码实力堪忧。
而且weblogo3导出的EPS格式也没法打开，又因为数据是蛋白序列，不像核酸序列因子那么少。 不知道站内各位高手有无解决办法，或者简洁一点的代码。
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