singularity 同一个 SIF 镜像能否启动多个容器？答案是可以

于 2024-08-15 04:40:16 发布
阅读量22 收藏
点赞数 1
文章标签： singularity
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/shimly123456/article/details/141204910
版权

sbatch 像下面这样写即可

#!/bin/bash
#SBATCH -o job.%j.out
#SBATCH --partition=cpu
#SBATCH -J whatever
#SBATCH -N 1
#SBATCH --qos=cpu
#SBATCH -c 16   

singularity run pytorch_22.08-py3.sif sleep 100 &> task1 & 
singularity run pytorch_22.08-py3.sif python --version &> task2 & 

wait

记得一定要加 wait，否则 task1 和 task2 两个日志文件不会出来

shimly123456
关注
  • 1
    点赞
  • 踩
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
singularity的镜像文件存在形式，以及它们的转换
qq_40256654的博客
02-21 297
特点: SIF是从Singularity 3.x版本开始引入的默认镜像格式。这是一个单文件格式，包含了容器的全部内容，包括操作系统、应用程序及其依赖项。SIF格式设计为不可变的，以确保安全和可重复性。用途: 由于其不可变性和单文件特性，SIF文件非常适合分发和共享。
Singularity:轻松管理多个数据库
05-14
Singularity提供了一个抽象的数据库API，这意味着开发人员可以使用同一套接口来与不同的数据库系统交互，如PostgreSQL、SQLite、H2和MySQL。这种抽象层减少了对特定数据库语法的依赖，使得代码更具有可移植性，同时...
Docker镜像转Singularity镜像的全过程
EE呈双的博客
01-23 5261
原本Docker镜像挺好用的，但是最近做项目需要用到超算的集群，Docker无法在上面用，需要将Docker镜像转为singularity镜像 这里写自定义目录标题欢迎使用Markdown编辑器新的改变功能快捷键合理的创建标题，有助于目录的生成如何改变文本的样式插入链接与图片如何插入一段漂亮的代码片生成一个适合你的列表创建一个表格设定内容居中、居左、居右SmartyPants创建一个自定义列表如何创建一个注脚注释也是必不可少的KaTeX数学公式新的甘特图功能，丰富你的文章UML 图表FLowchart流.
踩坑 | docker 镜像转换为 singularity 容器
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
04-13 467
前述，我用 docker 制备了一个汇集多个生信软件的容器，其中一部分软件直接用apt-get install XXXX完成。这部分软件，理所当然会自动映射绕容器的/usr/bin目录。对应的，当docker镜像转换为 singularity 容器后，我们可以直接在singularity shell YYYY.sif后直接访问对应程序。但是，我还有一份部分软件，为了方便，全部放在docker镜...
从零开始制作PyTorch的Singularity容器镜像
nidongla的博客
06-15 511
技术背景购物返利 m.cpa5.cn 在前面的博客中，我们大篇幅的使用到了Docker和Singularity这两种常见的容器化编程环境解决方案，使得我们的各个编程环境能够更好的隔离。如果要展开讲解容器化编程环境的重要性的话，我们有可能会发现容器并不是那么的必须：比如解决python库的依赖冲突问题，我们可以选择使用python的virtualenv或者conda的虚拟环境；比如解决gcc的版本依赖冲突，我们可以手动配置和选择对应的版本；比如对于我们没有root权限和对外网络的环境，想要安装一些工具可以采.
docker镜像转singularity镜像后无法正常使用的一些解决方法；singularity添加环境变量
最新发布
weixin_52269481的博客
05-16 453
记录一下docker镜像转singularity镜像后无法正常使用的解决方法以及在singularity镜像中添加环境变量的方法。
singularity和docker的安装使用
weixin_44616693的博客
06-22 1975
singularity与docker功能相似，但是相比与docker需要root权限，或者专门添加用户组，singularity在非root时也可使用，且轻量级，修改方便。#修改文件/etc/sudoers，chmod 775 /etc/sudoers & vim /etc/sudoers。#安装docker后，会自动生成docker用户组，若是没有，手动生成：sudo groupadd docker。#再次强调~/.bashrc文件对用户的重要性，进行备份，防止多次source，破坏文件。
Singularity（三）| 将docker转化为singularity容器
long_1998的博客
03-12 1544
如果准备使用的 Docker 镜像已经上传到 Docker Hub (https://hub.docker.com/) 或 Quay (https://quay.io/) 等 Docker 托管存储库中，我们可以直接下载并将其转化为 Docker 容器。然而，在测试和调试期间，我们一般会需要一个可改写的沙箱（sandbox）格式（实际上就是一个目录）。对于想移植到其它主机上的 Docker 镜像，例如，biobakery/lefse，镜像ID为 c6ab05d10f7f，使用。
singularity 使用
qq_53666171的博客
08-29 1797
生信平台搭建之-singularity的运用
Singularity实践教程 + Docker 转 Singularity 的避坑指南
Qy_sfsh的博客
07-08 9603
因研究需要，复现某论文，使用的是某校的服务器集群。他们服务器使用的容器是Singularity，而之前自己在院里用的时docker。docker学了没多久，就开始Singularity。恰恰是会一点docker，所以在转用singularity的过程中，踩的坑比较多（造孽啊）。记录一下，前事不忘，后世之师.........
国科大超算平台上Singularity 容器实践.pdf
08-24
中科科学院大学超算平台上的 Singularity 容器实践
singularity-cri:Kubernetes 容器运行时接口的 Singularity 实现
05-31
奇点-CRI Singularity-cri 和 wlm-operator 项目由 Sylabs 创建，用于探索 Kubernetes 和 HPC 世界之间的交互。 2020 年，我们没有将我们的精力分散在大量... Singularity-CRI 由两个独立的服务组成：runtime 和 im
singularity-conda-multiple-envs:基于Conda的多环境bash脚本的奇异容器化
03-21
基于Conda的多环境bash脚本的容器化。 要求 conda（ ）和 用于Docker。 手动执行 # environments creation conda env update --file environment-01.yml conda env update --file environment-02.yml conda env ...
singularity-rstudio:单一容器中的RStudio服务器
05-22
您可以使用以下命令构建名为singularity-rstudio.simg的本地奇点映像： sudo singularity build singularity-rstudio.simg Singularity 部署 您可以使用以下方法从下载预构建的图像，而不用自己构建它： ...
neurodocker:生成自定义Docker和Singularity映像，并最小化现有容器
05-14
Neurodocker是一个命令行程序，可为神经成像生成自定义Dockerfile和奇点配方，并最小化现有容器。 例子： 安装 使用Neurodocker Docker映像（推荐）： docker run --rm repronim/neurodocker:0.7.0 --help Docker...
singularity-compose:奇异容器的编排（正在开发中）
05-05
奇点组成 这是一个类似于Docker Compose的用于Singularity容器的简单编排库。 有关详细信息，请参见和，或以下更多示例。例子请参阅我们的存储库，以查找或提供使用scompose的示例。
containers:Dockerfile和Singularity定义文件的集合，用于构建在Roar集群上使用的容器！
04-02
如果您有兴趣向此存储库添加更多容器，请继续阅读！储存库结构这是所有相关文件在此存储库中存储位置的简要概述： /docker docker-存储所有Dockerfile的位置。 /singularity存储所有奇点定义文件的位置。 /share/...
workshop-singularity:具有奇异性的软件容器的研讨会资料
04-10
具有奇异性的软件容器 具有奇异性的软件容器的研讨会材料。 概述软件容器以及如何使用... 用所需的软件环境构建一个容器，您可以在个人或工作站计算机，CARC的高性能计算集群以及云中运行它。 幻灯片： ： 额外资源
从 singularity 拉取镜像
07-25
您可以使用以下命令从 Singularity Hub 拉取镜像： ``` singularity pull [选项] 镜像名称 ``` 请将 `[选项]` 替换为您想要使用的选项，将 `镜像名称` 替换为您想要拉取的镜像的名称。 例如，如果要从 Singularity Hub 上拉取名为 `ubuntu` 的 Ubuntu 镜像，可以运行以下命令： ``` singularity pull ubuntu.sif library://ubuntu/ubuntu:latest ``` 这将创建一个名为 `ubuntu.sif` 的 Singularity 镜像文件，并将最新的 Ubuntu 镜像存储在其中。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值