scanpy细胞图谱细胞类型合并

在用scanpy进行单细胞分析时常常要对聚类后的簇进行细胞标注并生成细胞图谱，但是在通常使用的更改注释的方法中

new_cluster_names = []
adatas.rename_categories('leiden', new_cluster_names)

new_cluster_names的字符不允许重复，而我无法确保每一个簇的细胞类型都不相同，于是我只能在相同的细胞类型后添加_num进行注释，如Bcell_1, Bcell_2

用此方法生成的细胞图谱如下所示

真的是相当难看，观察起来也很费劲。

所以我一直在想怎么才能把相同的cell type进行合并。后来我想到了一个替代方案。我在anndata中找到了这样一组注释adata.uns['leiden_colors']，

我猜测每次生成umap，图中的颜色都是从这个数组中取得的，于是我尝试把相同cell type的颜色改为一致。修改后生成的图如下所示：

好吧，现在相同cell type的颜色总算是一致了，总体美观多了，就是右侧的类型注释还是没有做到合并。

于是我又猜测，我在第一次调用画图函数
sc.pl.umap(adatas, color='leiden', legend_fontsize='xx-small')时，关于分类信息只传入了leiden，我猜测函数可能是根据这一分类依据自动创建了leiden_color并进行分类和上色。那我创建一个允许重复的列表传入分类数据不就可以实现cell type合并了吗？

于是我进行了以下操作

adatas.obs['leiden_poly'] = adatas.obs['leiden'].str[:-2]

现在再来画图看看

sc.pl.umap(adatas, color='leiden_poly', legend_fontsize='xx-small')