医学图像处理经验

1、归一化过程

        CT图像推荐采用 “减去固定值，除以固定值”的方式，以便保留灰度值信息；不建议减去均值再除以方差

2、注意事项

        图像和mask的spacing、direction、origin等要注意是否一致，在img_itk -> img_arr -> img_itk的过程中，建议使用img_aft.CopyInformation(img_bf)一键保证各种参数一致性

3、dicom匿名化

        患者名，患者地址，医院名，医院地址

4、dicom不解压快速读取信息

        相当于把里面的第一个的dicom读到内存里，然后用pydicom读取信息。 参数stop_before_pixels=True，表示不用读数据

        这样只适用于一个zip都是一个pid的情况

import zipfile

from io import BytesIO

import pydicom

with zipfile.ZipFile(f1, 'r') as zip_file:
    blob = zip_file.read(zip_file.namelist()[1])
    ds = pydicom.dcmread(BytesIO(blob), stop_before_pixels=True)