R语言：创建bioconductor的package

创建bioconductor的package

Bioconductor是生物信息在R语言中常用的软件包，我是做计算生物学中方法学的，所以打算把自己设计的方法做成一个package。

写package的教程，有以下两个文档：
简易版：
Bioconductor官方简介
完全版：
R官方简介

BioC的package本质上是一个R package，BioC的官方简介是R官方简介的简易版本。

按照Bioconductor的介绍

• 在R studio中创建package。自己写的script应该放在“R”文件夹下面。
• 修改DESCRIPTION文件，添加描述，用快捷键ctrl+shift+B来build。

• 修改NAMESPACE。
  在NAMESPACE里面定义两个东西：

  export(‘myFun’,’hello’,’pname’)
  import(‘GenomeInfoDb’)

第一行是展示给user的函数，第二行是在自己的包里面需要调用的别的包的名字。

• documenting manual pages
  写manual要用’.Rd’格式写，命名就是‘MyPkg-package.Rd’。记得要给你写的每个函数都写一个manual，在‘man’