R环境pRRophetic包的下载方法

pRRophetic包是一个药敏预测的包，由Paul Geeleher团队由2014年发布，是一个比较经典的R包（这个团队也在2021年推出了新的预测R包OncoProdict），但是这个R包并没有提交到cran或者bioconductor，一直在自己进行维护，因此这个包并不能通过install.package('pRRophetic')或者
biocmanager::install('pRRophetic')进行下载安装

笔者在学习pRRophetic的使用时发现，C站少有写这个包安装方法的文章，因此笔者将自己的学习写成本笔记，欢迎大家批评指正

1.下载pRRophetic的压缩包

首先需要在作者发布的网站上找到这个包的压缩包下载链接，下面附上网站链接

OSF | pRRophetic R package Wikihttps://osf.io/5xvsg/wiki/home/在网页中找到下面这个链接就可以下载了（有大约500个M），下载后将pRRophetic_0.5.tar.gz压缩包直接放在一个自己知道的路径下，不需要解压

2.打开Rstudio，利用可视化方式进行安装

（1）首先安装pRRophetic包需要的R包

BiocManager::install(c('sva', 'car', 'genefilter', 'preprocessCore', 'ridge'))

（2）点击package界面的install按钮

 （3）在弹出的install窗口中install from下拉菜单栏找到Pacakge Achieve File选项并Browse到自己存放pRRophetic_0.5.tar.gz压缩包的路径

 然后点击install就可以下载安装了，要是有提示缺少某个包的话就先安装这个包再按照上面的流程再次安装即可

此外在包作者的GitHub上可以找打这个包的说明，链接也附在下面

nullhttps://github.com/paulgeeleher/pRRophetic

对于这个包，目前笔者还没有仔细的研究，只会部分运用其完成部分药敏推测的需求，有时间笔者会学习一下这个R包的功能和OncoProdict包的功能