Rocky 9 安装 pysam 极简版

已于 2024-06-20 09:07:23 修改
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分类专栏： 软件 文章标签： python
于 2024-06-20 09:05:37 首次发布
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一键安装: pip install pysam
事情如果如此简单也就不用写这个博客了。
使用的Anaconda,本来想就着原来的环境，结果GG了。遂新建环境一枚。

mamba的安装在我另一篇博客。

conda create -n pysam python=3.10 ipykernel

conda activate pysam

mamba install -c conda-forge libstdcxx-ng=13.2.0

mamba install  -c conda-forge libcurl=8.8.0 libdeflate=1.20

mamba install -c bioconda pysam=0.22.1

mamba install biopython=1.78

pysam
weixin_42594968的博客
12-19 2156
仅在Linux上工作 安装：pip install pysam 对于pysam，我是利用fetch方法来查询VCF文件，调用fetch方法需要先对vcf文件建立索引： /home/user/htslib/htslib-1.14/bgzip -c chr22.dbsnp.noGT.recode.vcf > chr22.dbsnp.noGT.recode.vcf.gz bcftools index -c chr22.dbsnp.noGT.recode.vcf.gz 然后生成一个csi文件。 pytho
Installing pysam (仅为记录)
StuTan
12-10 2430
使用Conda install 安装（Linux环境） 使用的命令： conda config --add channels r conda config --add channels bioconda conda install pysam This will install pysam from the bioconda channel and automatically makes sure that dependencies are installed. Also, compilation fla
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05-07 7819
pysam目前不支持windows系统，网上所谓的pysam-win,nrel-pysam我均尝试过。最后还是选择使用linux系统。 在linux系统下的pycharm中直接pip install pysam也失败，第一次报错是超时，修改镜像为阿里云，下载成功但安装失败。第二次准备直接使用wheel安装，去相应网站下载对应版本的pysam.wheel，注意m和mu的区别。 Python pysam项目安装包(第三方库)下载资源&安装指南页面 - PyPI - Python中文网 ...
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rocky9 安装XDRP
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对不起，您的信息似乎有些混淆，因为"rocky9"不是一个已知的操作系统或软件名称，而且XDRP可能是误拼为XRDP，这是Ubuntu上用于远程桌面访问的一个程序，而"Rocky9"并不直接关联到这个功能。 如果您是在Ubuntu系统（而非RockyLinux或其他系统）上安装XRDP，可以参考以下步骤： 1. **打开终端**： ``` sudo su # 输入密码以获得root权限 ``` 2. **更新软件包列表**： ``` apt-get update ``` 3. **安装XRDP**： ``` apt-get install xrdp ``` 4. **启动和自动运行XRDP服务**： ``` sudo systemctl start xrdp sudo systemctl enable xrdp # 设置开机启动 ``` 5. **可能需要配置**，比如添加允许RDP连接的防火墙规则： ``` ufw allow 'in来自any to any port 3389' ufw reload ``` 请注意，某些防火墙可能已经默认阻止了端口3389，所以这一步骤可能会有所不同。 如果你正在寻找名为"Rocky9"系统的XRDP安装指南，可能需要确认该系统的特性和资源库，因为这个名称并不常见于主流Linux发行版。
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