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原创 「目的蛋白修饰鉴定」结果分析:检测位点不全/无预测位点,有哪些解决方案?
重金做完目的蛋白的修饰鉴定,却发现结果中找不到前期预测或报道的关键调控位点?基于我们大量的项目经验,丸子以磷酸化修饰为例总结了四大拯救方案,今天就给大家分享一下。
2026-04-03 09:00:00
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原创 【靶点验证分析】qPCR和WB结果趋势为什么不同 —— 原因分析和解决方案
qPCR和WB结果趋势不一样的原因有哪些?别再归因为实验失败而放弃了!
2026-04-02 09:00:00
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原创 高致病性RNA病毒研究 | 并发修饰鉴定在SARS-CoV-2/IAV/RSV中的前沿应用
基于OMS开放式搜索的并发修饰鉴定,在SARS-CoV-2/IAV/RSV等高致病性RNA病毒中的前沿应用。
2026-04-01 09:00:00
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原创 打破“mRNA=蛋白”思维定势:靶点筛选中转录组和蛋白质组的关系与抉择
mRNA丰度和蛋白表达水平是何关系?靶点筛选中转录组学和蛋白质组学该选哪个?
2026-03-31 09:00:00
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原创 低丰度成瘾蛋白靶点挖掘,有哪些值得借鉴的研究思路与组学技术?
今天我们结合近年领域顶级研究进展与实操经验,完整拆解从靶点挖掘维度锚定、样本前处理技术突破、质谱采集策略优化、AI辅助生信筛选,到靶点因果性验证的全流程可落地研究思路,帮大家打通从组学大数据到临床转化候选靶点的完整闭环。
2026-03-26 17:20:18
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原创 蛋白翻译后修饰绝对定量:如何精准剥离“蛋白表达量波动”与“假阳性信号”?
科研中很多研究者在蛋白翻译后修饰定量分析时,常混淆位点修饰程度差异与蛋白表达量差异,仅凭火山图差异信号直接下结论,易掉入定量陷阱。二者是完全独立的生物学事件,只有明确界定核心差异,才能获得真实可靠的修饰调控结论。
2026-03-26 09:00:00
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原创 哈佛医学院2026官方SOP:靶蛋白翻译后修饰IP-LC-MS/MS完整实验方案
本指南基于哈佛医学院团队2026年1月发布于Springer Nature旗下protocols.io平台的权威实验方案,针对细胞样本靶蛋白特异性富集、肽段序列鉴定及磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等常见PTM的高置信度质谱检测,旨在为相关研究建立可重复、高可靠性的标准操作。
2026-03-25 09:00:00
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原创 缺乏构效关系(SAR)怎么找靶点?从活体全景解析到肽段级口袋定位「抑菌分子靶点筛选」技术的适配选择
抗菌分子靶点初筛:标记和无标记技术该怎么选?哪个技术适配你的分子?经费有限、平台条件一般,能不能做无偏倚的靶点初筛?
2026-03-24 09:00:00
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原创 蛋白翻译后修饰研究在植物逆境响应、病原菌互作及作物遗传改良中的应用
今天我们结合领域最新进展,梳理植物逆境响应、病原菌互作、作物遗传改良中蛋白翻译后修饰的核心应用,分析相关技术突破,给大家提供更多的课题思路。
2026-03-23 09:00:00
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原创 蛋白翻译后修饰 | 磷酸化、甲基化、泛素化等五大PTMs作为双向开关调控液液相分离(LLPS)的研究概览
今天我们将系统阐述LLPS的研究意义与核心调控体系,明确PTMs在LLPS研究中的核心地位,并结合经典研究案例,解析不同类型PTMs对LLPS的调控机制,以及如何通过相关技术开展LLPS的功能与机制研究。
2026-03-20 09:00:00
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原创 【蛋白互作研究】上下游关系实锤策略:因果闭环+误区规避+全流程落地
上一篇我们讲解了蛋白上下游关系判定的核心环节,获取了单向调控相关性证据,但蛋白组学数据无法区分直接与间接调控,也无法证实调控与生物学功能的因果关联。本篇我们继续聚焦证据链闭环构建,通过三大核心模块完成机制转化,实锤蛋白间上下游调控关系。
2026-03-19 09:00:00
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原创 【蛋白互作研究】判定蛋白上下游调控关系的3大核心标准与靶向验证策略
Co-IP、AP-MS等技术仅能证明蛋白的细胞内空间关联,但无法明确信号级联的单向调控关系,而上下游调控的因果性验证是蛋白机制研究的核心。今天将系统讲解其前序核心环节,助力完成假说构建、锁定调控模式、锚定蛋白上下游方向。
2026-03-17 10:32:38
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原创 【靶点筛选样本前处理②】细胞核蛋白标准化制备、污染防控与前沿展望
作为细胞遗传信息储存、转录调控的核心场所,细胞核是表观遗传、信号转导研究中最受关注的亚细胞组分,其蛋白提取的技术门槛与质控要求更高。今天我们将聚焦细胞核蛋白的全流程提取实操,同时对亚组分提取体系进行总结与前沿展望。
2026-03-17 10:17:42
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原创 【靶点筛选样本前处理①】细胞膜蛋白的全流程提取实操:标准化制备及验证
高纯度的细胞亚组分提取,已成为Western Blot、免疫共沉淀(Co-IP)、高分辨率质谱检测(LC-MS/MS)等实验的核心前置步骤。今天我们将聚焦细胞膜蛋白的全流程提取实操,为膜蛋白样本前处理提供可落地的学术指导。
2026-03-16 09:00:00
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原创 蛋白翻译后修饰研究的方法学演进:WB/ELISA/IHC/IF/流式细胞术 vs. 质谱/蛋白芯片
目前主流的PTM检测技术主要分为传统抗体依赖型技术和高通量蛋白质组学技术两大类,两类技术的原理、特性与适用场景差异显著。今天我们就详细对比两类技术的核心特点与优劣势,明确不同研究场景下的实验策略选择,为PTM研究的技术选型提供实用参考。
2026-03-13 09:00:00
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原创 以药找靶全路径:从结构相似性、反向筛选与AI建模预测到蛋白质组学实验验证
如今,依托计算科学、人工智能和高分辨生物分析技术,靶标发现形成“计算预测缩范围,实验验证定靶标”的黄金法则,通过四步联用快速锁定候选靶标、精准实验确证,让这项工作从“大海捞针”变为系统化研究。
2026-03-12 09:00:00
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原创 蛋白翻译后修饰的六大预判依据,从初筛到确证全攻略
今天我们就从实验室最常见的现象入手,从实验现象捕捉到质谱确证,带大家系统梳理判断目的蛋白发生PTM的六大核心依据。
2026-03-11 09:00:00
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原创 五大功能特化型蛋白翻译后修饰(PTMs)重塑肿瘤与免疫新蓝海:糖基化、棕榈酰化、肉豆蔻酰化、异戊二烯化与硫酸化
今天继续系统梳理领域内研究最深入的剩余五大功能特化型PTMs——糖基化、棕榈酰化、肉豆蔻酰化、异戊二烯化、硫酸化。从分子机制、靶位点特征、生物学功能、疾病关联与权威研究资源,明确其与核心调控型PTMs的功能互补关系,为大家构建全面、闭环的PTMs研究。
2026-03-10 09:00:00
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原创 一文读懂五大蛋白翻译后修饰PTMs:磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化与SUMO化的调控网络
在已发现的超400种PTMs中,十大高关注度类型可清晰划分为两大体系:一类是核心调控型PTMs;另一类则是功能特化型PTMs。今天我们先聚焦第一类PTMs,从其发现历程、分子机制、靶位点特征,到核心生物学功能与疾病关联,为大家系统梳理这一调控体系的核心脉络。
2026-03-09 09:00:00
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原创 蛋白翻译后修饰王牌数据库:iPTMnet(AI文本挖掘) 与CPLM 4.0(赖氨酸竞争性修饰)的应用指南
今天我们将聚焦于两款细分领域的王牌资源——iPTMnet与CPLM 4.0。iPTMnet是挖掘前沿新靶点的利器;CPLM 4.0则深耕赖氨酸修饰,成为研究修饰串扰与位点竞争的核心资源。并梳理一套数据库选型指南与多库联用方案,助力大家在复杂的调控网络中精准定位功能靶点。
2026-03-06 09:00:00
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原创 【蛋白翻译后修饰工具①】UniProt、dbPTM、Phospho Site Plus (PSP)核心数据库深度解析与应用指南
做PTM研究有没有好用的数据库?丸子专门对领域公认的5大王牌数据库进行盘点!今天我们先拆解3个通用性最强、入门必学的核心数据库,不管是刚接触PTM的新手,还是做大规模组学筛选、精细机制研究的资深科研者们,都能直接适配。
2026-03-05 09:00:00
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原创 蛋白翻译后修饰鉴定|如何通过WB条带判断蛋白是否发生了磷酸化/乙酰化/泛素化/糖基化/甲基化修饰?
PTMs是蛋白功能调控的核心,磷酸化、糖基化、泛素化等修饰会改变蛋白的分子量、构象、电荷等理化性质,直接体现在电泳结果上。今天就带大家从直观现象识别、针对性实验验证、生信预实验预测、实操避坑优化四个维度,手把手教你精准判断蛋白修饰!
2026-03-04 09:31:09
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原创 七大膜蛋白数据库应用盘点 | Uniprot / InterPro / TCDB / SURFY / PDB / TMHMM / OPM:从注释到结构的全解析
今天丸子整理了膜蛋白研究全流程必备的7大权威数据库,从基础的蛋白定位注释,到专属的转运蛋白分类,再到三维结构与跨膜区预测,全覆盖、无死角,帮你一站式搞定膜蛋白的生物信息学分析。
2026-03-03 09:00:00
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原创 以药找靶:药物与靶点共价vs非共价结合的鉴定逻辑与核心筛选技术的盘点
药物与靶点的结合,分“共价结合”和“非共价结合”两种完全不同的形式,二者的筛选逻辑、技术选择天差地别。选错技术会浪费大量时间、试剂和样本,甚至让整个课题陷入停滞。今天我们就来系统盘点,如何精准预判结合形式,并选择最适配的靶点筛选技术。
2026-03-02 09:00:00
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原创 膜蛋白提取攻略 | 从粗分到纯化:去垢剂筛选、纳米盘重构到生物素标记富集的全覆盖选择指南
疏水性强、构象高度依赖磷脂双分子层、天然丰度极低,这些特性让膜蛋白的提取成为了绝大多数实验的第一道“拦路虎”。今天我们就系统盘点膜蛋白的主流提取方法,从基础粗分到进阶纯化,从结构鉴定到功能研究,帮你选对最适合的实验方案。
2026-02-28 09:00:00
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原创 液-液相分离研究 | 邻近标记PL-MS如何重构转录调控、应激响应与肿瘤免疫新视野?
今天我们将系统梳理LLPS的生物物理基础与核心科学命题,解析邻近标记技术突破LLPS研究瓶颈的核心原理,结合顶级期刊的经典研究案例,全面阐述该技术在LLPS领域的应用进展,为相关领域的科研工作者提供理论与技术参考。
2026-02-27 08:30:00
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原创 「膜蛋白互作最新进展」SPARK-seq与适体组学:单细胞分辨率下的膜表面天然蛋白互作解析
今天就带大家一起从方法学机制、解决的关键科学问题及“适体组学”的战略意义三个维度,对Science上发布的这项SPARK-seq技术进行深入剖析,看看这项技术如何突破膜蛋白原位功能研究的困局。
2026-02-26 09:00:00
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原创 APEX-seq/BioID邻近标记(PL-MS)技术:解码RNA颗粒的蛋白质组成及相互作用网络
真核细胞中,RNA 与 RNA 结合蛋白经液 - 液相分离组装的无膜 RNA 颗粒,是分子生物学研究热点。它调控 mRNA 全生命周期,关联多种生理病理过程,本文将系统解析其相关内容,并结合顶刊研究详解其调控机制。
2026-02-25 09:00:00
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原创 如何用邻近标记质谱(PL-MS)技术破解脑肠轴的跨器官对话?
肠道分泌的蛋白究竟去往何处?为破解这一研究“黑箱”,我梳理大量文献后发现,邻近标记技术竟能实现分泌蛋白的活体示踪!今天就为大家分享我基于文献研究进行的“利用TurboID为分泌蛋白进行标记”的实验猜想,一同探讨能否从复杂的血浆背景中,精准捕捉到真正的脑肠轴“信使”分子。
2026-02-24 14:48:54
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原创 5年1.5万篇文献大数据:靶点筛选双子星有限蛋白水解质谱(LiP-MS)与热蛋白组分析(TPP)的全景对比
基于Lens.org平台,我们分别对2020-2025年LiP-MS领域8702篇、TPP领域6714篇学术成果开展多维度统计分析,从研究体量、核心力量、学科特征等方面进行全景对比,并深入探讨两项技术的应用趋势,为领域内研究提供参考。
2026-02-13 09:00:00
1057
原创 邻近标记PL-MS重构病毒-宿主互作图谱 —— 基于SARS-CoV-2、MHV及流感病毒经典研究的深度复盘与思考
今天,小谱将结合三篇非常经典的病毒学文献(涵盖新冠病毒、小鼠肝炎病毒和流感病毒),和大家聊聊这项技术是如何颠覆我们对病毒-宿主互作认知的,以及我们在实际课题设计中可以如何借鉴。
2026-02-12 09:00:00
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原创 【药物靶点筛选】免修饰药物靶点筛选策略深度解析:技术原理、实操指南与选型决策
结合权威数据库及实验方案库的最新资料,今天我们将全方位拆解免修饰药物靶点筛选技术,从纯化蛋白的生物物理表征到细胞及裂解液环境的蛋白质组学靶点垂钓,为你提供详尽的选型指南与实操避坑手册。
2026-02-11 09:00:00
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原创 【药物靶点筛选】如何判断我的化合物在进行靶点筛选时是否能够进行修饰?
今天我们一起探讨:化合物修饰是否会影响我的药物活性?什么化合物适合做修饰,什么化合物特征不适合做修饰?我们该如何判断手中的化合物能否用于修饰筛选?确定修饰可行性后,又该从众多靶点筛选技术中选择适配方案?
2026-02-10 09:00:00
1684
原创 拆分式邻近标记 | Contact-ID、Split-APEX2与Split-TurboID在细胞器接触位点研究中的应用解析
今天我们就按技术发展历程,带大家深度解析Split-APEX2、Contact-ID、Split-TurboID这些拆分式邻近标记技术在线粒体-内质网接触位点等【细胞器接触研究】中的优劣势、实战案例,帮你快速匹配适配自己研究的工具!
2026-02-09 09:00:00
1781
原创 靶蛋白研究中基因敲除、敲入、点突变、RNA编辑与表观遗传编辑的区别与应用
今天我们系统梳理了靶蛋白研究中最常用的6大基因编辑形式,通过清晰表格呈现其核心策略、适配科研问题及典型应用场景,兼顾学术严谨性与实用指导性,希望能助力大家快速锁定最优技术方案。
2026-02-06 09:00:00
727
原创 邻近标记酶谱解析:基于BioID家族「BioID/TurboID/AirID/ultraID」和过氧化物酶家族「APEX/APEX2」的深度对比
在邻近标记酶中,BioID家族与过氧化物酶家族在酶学特性、标记效率与应用场景中的差异,常令研究者难以抉择。今天,我们将基于权威文献,对这些标记酶进行详尽的酶学特性剖析,以及应用场景的深度探讨,全方位解析如何为特定的生物医学问题选择最合适的工具。
2026-02-05 09:00:00
864
原创 邻近标记全流程实验指南:从质粒构建、标记富集到数据分析的超全解析(TurboID篇)
本指南以TurboID为核心示例展开,系统梳理从质粒构建、细胞标记、样品制备到质谱检测与数据分析的全流程,无需复杂的前期经验即可上手。
2026-02-04 09:00:00
918
原创 从标记蛋白到锁定氨基酸:Spot-ID/BioID邻近标记实现分子空间组学突破
Spot-ID与Spot-BioID的出现,实现从“标记整个蛋白”到“精准标记氨基酸修饰位点”的跨越,在不破坏内源性微环境的前提下,捕捉分子空间分布的“原子级”细节。
2026-02-03 09:00:00
860
原创 「亚细胞定位」技术的深度对比:融合荧光蛋白/免疫荧光/亚细胞组分分离/邻近标记
今天带大家系统的梳理一下「互作蛋白研究」中传统和新兴的「亚细胞定位技术」,通过对比其核心应用场景、优势与局限,为精准开展 PPI 研究提供学术参考,助力大家突破 “空间有效性” 验证的核心瓶颈。
2026-02-02 09:00:00
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