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风花雪月西柠鸭
Set your course by the stars, not by the lights of every passing ship.
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【论文阅读】Cyro-EM数据处理软件Dynamo
首先,Dynamo允许用户透明地适应各种高性能计算平台,如gpu或CPU集群。其次,Dynamo通过GUI界面和脚本资源实现了用户友好性。第三,Dynamo通过插件API提供用户灵活性。除了校准和平均程序,Dynamo还包括用于可视化和分析结果和数据的本地工具,以及对第三方可视化软件的支持,如Chimera UCSF或EMAN2。作为这些功能的一个演示,我们研究了细菌鞭毛马达,并显示自动检测的类缺乏和存在的c环。原创 2023-10-13 11:00:28 · 364 阅读 · 0 评论 -
【论文阅读】DeepContact:基于电子显微镜成像的MCS高通量量化
膜接触点(MCS)介导的细胞器间的相互作用在细胞中发挥着重要作用。对MCSs的定量分析揭示了在各种生理和病理条件下细胞反应。然而,目前还缺乏一种有效的定量分析工具,在这种背景下,作者就开发了DeepContact,一种用于优化细胞器分割和接触分析,基于无标签EM的深度学习协议。DeepContact在交互式可视化方面具有高效率和灵活性,能适应细胞器的新形态,并能识别多种宽度范围内的接触,从而能对多个系统中各种类型的MCS进行统计分析。原创 2023-09-13 21:36:20 · 1812 阅读 · 1 评论